ゲノムマイニングによって駆動される新しい生物活性天然物の発見

微生物天然物は、創薬の重要な源です。ますます多くの微生物ゲノムが配列決定されるにつれて、バイオインフォマティクス分析は、新しい天然産物の膨大なリソースがあることを示しています。ゲノムマイニングは、遺伝子クラスター配列と生合成経路に基づく天然産物発見の新しい戦略です。同時に、天然産物の構造を合成経路に直接関連付け、生合成と組み合わせ生合成の研究を促進することができます。この論文では、バイオインフォマティクスの予測、メタボロミック比較、遺伝子操作を含むゲノムマイニングの戦略をレビューします。これは、微生物天然産物の可能性を活用するこの戦略の大きな利点を示しています。ゲノムマイニングの方法と技術の開発により、微生物天然産物資源の合理的な搾取を実現することが可能になります。

Microbial natural product is an important source for drug discovery. As more and more microbial genomes are sequenced, bioinformatics analysis shows that there are huge resources of novel natural products. Genome mining is a new strategy of natural product discovery based on gene cluster sequences and biosynthetic pathways. At the same time, it can directly associate the structures of natural products with synthetic pathways, and facilitate the study of biosynthesis and combinatorial biosynthesis. In this paper, the strategies of genome mining, including bioinformatics predictions, metabolomic comparisons and genetic manipulations, are reviewed, which shows a great advantage of this strategy in exploiting the potential of microbial natural products. With the development of genome mining methodology and techniques, it will be possible to realize rational exploitation of microbial natural product resources.