ネットワーク分析により、TNFは脊髄損傷後の反応性炎症の主要なハブとして明らかになります

脊髄損傷（SCI）は、脊髄再生を制限する反応性炎症やその他の有害なイベントにつながります。ネットワークトポロジ、遺伝子オントロジー、シグナル伝達経路、および疾患の推論のレベルでメカニズムを研究するためのアプローチを提案します。炎症性メディエーターを有毒化学物質として扱い、生物学的医療データベースとソフトウェアのセットを介して、遺伝子と相互作用タンパク質を回収しました。SCIに関連する10,000を超える遺伝子を特定しました。腫瘍壊死因子（TNF）は最高のスコアであり、トップ30はコアデータとして採用されました。コア相互作用タンパク質ネットワークでは、TNFおよびその他のトップ10ノードが主要なハブでした。コアメンバーは、細胞外空間および領域の成分として、タンパク質結合および受容体結合機能、およびTNFシグナル伝達経路として、細胞応答と代謝プロセスに関与していました。さらに、発作とSCIの両方がTNFレベルと高度に関連していました。したがって、SCI、TNFおよびその他の主要なハブに対するより良い治療効果を達成するためには、TNFのみなどの単一のターゲットではなく、ネットワーク介入理論に従って一緒に標的とする必要があります。さらに、てんかんの治療に使用される特定の薬物を使用して、SCIをアジュバントとして治療することができます。

Spinal cord injury (SCI) leads to reactive inflammation and other harmful events that limit spinal cord regeneration. We propose an approach for studying the mechanisms at the levels of network topology, gene ontology, signaling pathways, and disease inference. We treated inflammatory mediators as toxic chemicals and retrieved the genes and interacting proteins associated with them via a set of biological medical databases and software. We identified >10,000 genes associated with SCI. Tumor necrosis factor (TNF) had the highest scores, and the top 30 were adopted as core data. In the core interacting protein network, TNF and other top 10 nodes were the major hubs. The core members were involved in cellular responses and metabolic processes, as components of the extracellular space and regions, in protein-binding and receptor-binding functions, as well as in the TNF signaling pathway. In addition, both seizures and SCI were highly associated with TNF levels; therefore, for achieving a better curative effect on SCI, TNF and other major hubs should be targeted together according to the theory of network intervention, rather than a single target such as TNF alone. Furthermore, certain drugs used to treat epilepsy could be used to treat SCI as adjuvants.