調節性T細胞の単一細胞トランスクリプトミクスは、組織適応の軌跡を明らかにしています

非リンパ組織（NLT）は、ほとんど未踏の表現型と発達を伴う適応免疫細胞のプールを抱えています。単一細胞RNA-seqを使用して、マウスの皮膚および結腸に35,000 CD4+調節（TREG）および記憶（TMEM）T細胞を特徴付けました。これらの組織では、NLT表現型の異なる程度でTreg細胞の亜集団を特定しました。亜集団疑似視症と遺伝子動態は、皮膚と結腸への動員に一貫していたが、LNSの初期NLTプライミングとNLT機能適応の最終段階は組織固有の違いを反映した。予測された速度論は、in vivo in vivo黒色腫誘導モデルを使用して要約され、主要な調節因子と受容体を検証しました。最後に、ヒトの血液およびNLT TregおよびTMEM細胞を紹介し、哺乳類を超えた保存された組織シグネチャを特定しました。要約すると、計算予測の使用とin vivo検証を組み合わせて、Treg細胞の不均一性とNLTへの募集との関係について説明します。

Non-lymphoid tissues (NLTs) harbor a pool of adaptive immune cells with largely unexplored phenotype and development. We used single-cell RNA-seq to characterize 35,000 CD4+ regulatory (Treg) and memory (Tmem) T cells in mouse skin and colon, their respective draining lymph nodes (LNs) and spleen. In these tissues, we identified Treg cell subpopulations with distinct degrees of NLT phenotype. Subpopulation pseudotime ordering and gene kinetics were consistent in recruitment to skin and colon, yet the initial NLT-priming in LNs and the final stages of NLT functional adaptation reflected tissue-specific differences. Predicted kinetics were recapitulated using an in vivo melanoma-induction model, validating key regulators and receptors. Finally, we profiled human blood and NLT Treg and Tmem cells, and identified cross-mammalian conserved tissue signatures. In summary, we describe the relationship between Treg cell heterogeneity and recruitment to NLTs through the combined use of computational prediction and in vivo validation.