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5つのビフィドバクテリウム株、つまり2020BT、2028BT、2033BT、2034BT、および2036BTは、ヨーロッパのビーバー（キャスター繊維）、GoeldiのMarmoset（Callimicogoeldii）、黒capped Squirrel Monkey（saimiriboliviensubsp。dolagigsubsp。doliviensubsp。）から分離されました。これらの分離株はすべて、グラム陽性、通性嫌気性、d-フルクトース6-リン酸ホスホケトラーゼ陽性、非運動性および非堆積であることが示されました。16S RRNA遺伝子配列、多焦点配列（HSP60、RPOB、DNAJ、DNAG、およびCLPC遺伝子を含む）に基づく系統解析、およびコアゲノムは、ビフィドバクテリア株2020BT、2028BT、2033BT、2033BT、2034BT、2036BTの系統発生の関連性を示唆していることを明らかにしました。、Bifidobacterium bifidum lmg 11041t、bifidobacterium choerinum lmg 10510t、bifidobacterium gallicum lmg 11596t、bifidobacteris lmg 30297t、bididobacterium lmg lmg 30187tおよびbifidobacteri rmgcterium rmg。表現型分析と組み合わせた分離株のゲノム配列に基づいたさらなる遺伝子型付けは、これらの株がこれまでに認識されているビフィドバクテリウム種のそれぞれの株とは異なることを明確に示しています。したがって、Bifidobacterium castoris sp。11月。（2020BT = LMG 30937T = CCUG 72816T）、Bifidobacterium callimiconis sp。11月。（2028BT = LMG 30938T = CCUG 72814T）、Bifidobacterium samirii sp。11月。（2033BT = LMG 30940T = CCUG 72817T）、Bifidobacterium goeldii sp。11月。（2034BT = LMG 30939T = CCUG 72815T）およびBifidobacterium dolichotidis sp。11月。（2036BT = LMG 30941T = CCUG 72818T）は、新規ビフィドバクテリウム種として提案されています。
5つのビフィドバクテリウム株、つまり2020BT、2028BT、2033BT、2034BT、および2036BTは、ヨーロッパのビーバー（キャスター繊維）、GoeldiのMarmoset（Callimicogoeldii）、黒capped Squirrel Monkey（saimiriboliviensubsp。dolagigsubsp。doliviensubsp。）から分離されました。これらの分離株はすべて、グラム陽性、通性嫌気性、d-フルクトース6-リン酸ホスホケトラーゼ陽性、非運動性および非堆積であることが示されました。16S RRNA遺伝子配列、多焦点配列（HSP60、RPOB、DNAJ、DNAG、およびCLPC遺伝子を含む）に基づく系統解析、およびコアゲノムは、ビフィドバクテリア株2020BT、2028BT、2033BT、2033BT、2034BT、2036BTの系統発生の関連性を示唆していることを明らかにしました。、Bifidobacterium bifidum lmg 11041t、bifidobacterium choerinum lmg 10510t、bifidobacterium gallicum lmg 11596t、bifidobacteris lmg 30297t、bididobacterium lmg lmg 30187tおよびbifidobacteri rmgcterium rmg。表現型分析と組み合わせた分離株のゲノム配列に基づいたさらなる遺伝子型付けは、これらの株がこれまでに認識されているビフィドバクテリウム種のそれぞれの株とは異なることを明確に示しています。したがって、Bifidobacterium castoris sp。11月。（2020BT = LMG 30937T = CCUG 72816T）、Bifidobacterium callimiconis sp。11月。（2028BT = LMG 30938T = CCUG 72814T）、Bifidobacterium samirii sp。11月。（2033BT = LMG 30940T = CCUG 72817T）、Bifidobacterium goeldii sp。11月。（2034BT = LMG 30939T = CCUG 72815T）およびBifidobacterium dolichotidis sp。11月。（2036BT = LMG 30941T = CCUG 72818T）は、新規ビフィドバクテリウム種として提案されています。
Five Bifidobacterium strains, i.e. 2020BT, 2028BT, 2033BT, 2034BT and 2036BT, were isolated from European beaver (Castor fiber), Goeldi's marmoset (Callimicogoeldii), black-capped squirrel monkey (Saimiriboliviensissubsp. peruviensis) and Patagonian mara (Dolichotispatagonum). All of these isolates were shown to be Gram-positive, facultative anaerobic, d-fructose 6-phosphate phosphoketolase-positive, non-motile and non-sporulating. Phylogenetic analyses based on 16S rRNA gene sequences, multilocus sequences (including hsp60, rpoB, dnaJ, dnaG and clpC genes) and the core genome revealed that bifidobacterial strains 2020BT, 2028BT, 2033BT, 2034BT and 2036BT exhibit close phylogenetic relatedness to Bifidobacterium biavatii DSM 23969T, Bifidobacterium bifidum LMG 11041T, Bifidobacterium choerinum LMG 10510T, Bifidobacterium gallicum LMG 11596T, Bifidobacterium imperatoris LMG 30297T, Bifidobacterium italicum LMG 30187T and Bifidobacterium vansinderenii LMG 30126T, respectively. Further genotyping based on the genome sequence of the isolated strains combined with phenotypic analyses, clearly show that these strains are distinct from each of the type strains of the so far recognized Bifidobacterium species. Thus, Bifidobacterium castoris sp. nov. (2020BT=LMG 30937T=CCUG 72816T), Bifidobacterium callimiconis sp. nov. (2028BT=LMG 30938T=CCUG 72814T), Bifidobacterium samirii sp. nov. (2033BT=LMG 30940T=CCUG 72817T), Bifidobacterium goeldii sp. nov. (2034BT=LMG 30939T=CCUG 72815T) and Bifidobacterium dolichotidis sp. nov. (2036BT=LMG 30941T=CCUG 72818T) are proposed as novel Bifidobacterium species.
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