乳がんの病歴を持つ非菌性マイコバクテリア感染女性のsputにおけるミクロビオームの多様性

背景/目的：Mycobacterium Avium complex（MAC）によって引き起こされる非尿症のマイコバクテリア肺疾患（NTM）は、米国および世界中の健康問題の増加です。NTM疾患は、乳がんの現在の診断または病歴（BCA）を持つ白人女性で一般的であり、治療に大きな課題を抱えています。私たちは、NTMがかなりの治療耐性のある女性に影響を与えた女性が、疾患の進行と治療耐性を支援する非菌性マイコバクテリウム以外の病原性微生物を抱いている可能性があると仮定します。 方法：健康な女性、非尿症のマイコバクテリア肺疾患（NTM）の女性、および非菌性マイコバクテリア肺疾患と乳がん（NTM-BCA）の両方の女性からのSputaの微生物叢の多様性を評価しました。最初に、NTMとNTM-BCAのこれらの健康な女性と女性のSputaからSputaと分離DNAを収集しました。また、NTM-BCAの女性から血清由来の細胞外小胞からDNAを分離しました。被験者のさまざまなグループで多様な病原性微生物を特定するために、16S RDNAシーケンスを実行しました。データ分析は、ベイラー医学部のメタゲノムおよび微生物系研究センター（CMMR）の分析パイプラインを利用して実行されました。 結果：人体に住んでいる細菌、ウイルス、アーキアス、真菌などの居住微生物の大規模なコミュニティは、人間の健康と病気の重要な要素としてますます認識されています。Sputaの多様なミクロビオーム群集と、Streptococcus、Haemophillus、Veillonella、Neisseria、Prevotella、Fusobacterium、Bacteroides、Allistipes、Faecalibacterium、およびStaphylococcusの両方のnunceberculberculbercobacteterialの両方である女性の両方の女性の両方の女性の両方の女性の両方の女性の両方であるアリスペ、アリスペ、アリスペ、アリスペ、アリスペ、アリスペ、アロシンコが支配する細胞外小胞を特定しました。テリアル肺病気と乳がん。フソバクテリウム、バクテロイド、アリスピップなど、これらの属の一部はエストロボローム活性を持ち、乳房やその他の新生物に関連しています。 結論：この研究は、Sputaにおける非菌性マイコバクテリアとこれらの患者の循環細胞外小胞以外の明確な病原性微生物叢の存在を確認します。この情報は、NTM患者を治療するための治療設計を改善するために役立つ可能性があります。

BACKGROUND/AIMS: The nontuberculous mycobacterial lung disease (NTM), caused by Mycobacterium avium complex (MAC) is an increasing health problem in the USA and worldwide. The NTM disease is prevalent in Caucasian women with a current diagnosis or history of breast cancer (BCa), posing a significant challenge towards treatment. We hypothesize that NTM affected women with considerable therapeutic resistance may harbor pathogenic microbes other than nontuberculous mycobacterium, aiding in disease progression and therapeutic resistance. METHODS: We assessed microbiome diversity in sputa from healthy women, women with nontuberculous mycobacterial lung disease (NTM) and women with both nontuberculous mycobacterial lung disease and breast cancer (NTM-BCa). First, we collected sputa and isolated DNA from sputa of these healthy women and women with NTM and NTM-BCa. We also isolated DNA from sera derived extracellular vesicles from women with NTM-BCa. To identify diverse pathogenic microbes in various groups of subjects, we then performed 16S rDNA sequencing. Data analysis was performed utilizing the analytical pipelines at the Center for Metagenomic and Microbiome Research (CMMR), Baylor College of Medicine. RESULTS: A large community of resident microbes, including bacteria, virus, Archeas and Fungi live in the human body are being increasingly recognized as the key components of human health and disease. We identified a diverse microbiome community in the sputa and the extracellular vesicles dominated by Streptococcus, Haemophillus, Veillonella, Neisseria, Prevotella, Fusobacterium, Bacteroides, Allistipes, Faecalibacterium and Staphylococcus in women with nontuberculous mycobacterial lung disease as well as women with both nontuberculous mycobacterial lung disease and breast cancer. Some of these genera, including Fusobacterium, Bacteroides, and Allistipes have estrobolome activity and associated with breast and other neoplasms. CONCLUSION: This work confirms the presence of a distinct pathogenic microbiome other than nontuberculous mycobacteria in the sputa and the circulating extracellular vesicles of these patients. This information could be useful for better therapeutic design to treat the NTM patients.