ターゲットを絞った次世代シーケンスを通じて同定されたSPTB遺伝子のコピー数の変動によって引き起こされる遺伝性球状化症

遺伝性球状赤血球症 (HS) は、溶血性貧血を伴う末梢血塗抹標本の球状赤血球症を特徴とする不均一な遺伝性疾患であり、溶血の兆候を伴います。今回我々は、14q23.3の新たな271Kb微小欠失に起因するHSを患う生後5か月の韓国人女児を報告する。彼女は溶血性貧血と軽度の脾腫を患っていた。末梢血の検査で球状赤血球症が見られました。エオシン-5'-マレイミド (EMA) テストおよびフローサイトメトリー浸透圧脆弱性テストは陽性でした。彼女には球状赤血球症の関連する家族歴はありませんでした。HS 関連遺伝子には病原性一塩基変異や小さな挿入/欠失は検出されませんでした。アレイ比較ゲノムハイブリダイゼーション分析により、染色体 14q23.3 に SPTB、CHURC1、GPX2、RAB15、FNTB、および MAX 遺伝子を含む 271 Kb の欠失が明らかになりました。われわれは、ターゲット次世代シーケンス（NGS）解析を使用して、SPTB 遺伝子の 5' UTR、エクソン 1、およびイントロン 1 の一部に影響を与える欠失を発見しました。これは、NGS が疾患の原因となるコピー数変異（CNV）を特定できる可能性があることを示唆しています。HS患者における小さな点突然変異も同様です。さらに、染色体マイクロアレイは、結合した欠失遺伝子を定義するのに役立つ可能性があります。したがって、特に CNV が病気の原因となる異常であることが明らかになった場合には、HS の診断において追加の評価を考慮する必要があります。

Hereditary spherocytosis (HS) is a heterogeneous genetic disorder characterized by spherocytosis on peripheral blood smear with hemolytic anemia, accompanied by signs of hemolysis. Herein, we report a 5-month-old Korean girl with HS resulting from a de novo 271 Kb microdeletion of 14q23.3. She presented with hemolytic anemia and mild splenomegaly. Spherocytosis was seen on examination of peripheral blood. Eosin-5'-maleimide (EMA) test and flow cytometric osmotic fragility test were positive. She had no relevant family history of spherocytosis. No pathogenic single nucleotide variants or small insertions/deletions were detected in HS-associated genes. Array comparative genomic hybridization analysis revealed a 271 Kb deletion at chromosome 14q23.3, encompassing the SPTB, CHURC1, GPX2, RAB15, FNTB, and MAX genes. We found a deletion affecting 5' UTR, exon 1, and part of intron 1 of the SPTB gene using targeted next-generation sequencing (NGS) analysis, suggesting that NGS may be able to identify disease-causing copy number variations (CNVs), as well as small point mutations in HS patients. In addition, chromosomal microarray may be useful in defining combined deleted genes. Additional evaluations should thus be considered in the diagnosis of HS, especially when CNV is revealed as disease-causing abnormality.