下痢のある犬の4％で見つかったチャパルボウイルスDNA

原因不明の下痢の発生における犬からの糞は、新しいパルボウイルスのゲノムを明らかにするウイルスメタゲノミクスによって分析されました。パルボウイルスはカチャビロスと名付けられ、提案されたチャパルボウイルス属内に分類されました。PCRを使用して、カチャビロスDNAは、その発生から9匹のテストされた犬のうち2匹で検出されました。このウイルスの臨床的影響を解明し始めるために、2,053個の犬の糞便サンプルをリアルタイムPCRを使用してスクリーニングしました。203人の健康な犬の便サンプルは、1.47％の割合でカチャビロスDNAに対して陽性でしたが、2017年に収集された802の下痢サンプルと2018年に収集された964のサンプルは、それぞれ4.0％および4.66％の頻度で陽性でした（2017-20180.05の下痢のp値を組み合わせた。83の血まみれの下痢サンプルは陽性ではありませんでした。ウイルス量は一般に低く、3つの陽性グループすべてで平均リアルタイムPCR CT値が36でした。胎盤肉食動物の糞で報告された最初のチャパルボウイルスであるカチャビロスの種のトロピズムと病原性は、完全に決定されていない。

Feces from dogs in an unexplained outbreak of diarrhea were analyzed by viral metagenomics revealing the genome of a novel parvovirus. The parvovirus was named cachavirus and was classified within the proposed Chapparvovirus genus. Using PCR, cachavirus DNA was detected in two of nine tested dogs from that outbreak. In order to begin to elucidate the clinical impact of this virus, 2,053 canine fecal samples were screened using real-time PCR. Stool samples from 203 healthy dogs were positive for cachavirus DNA at a rate of 1.47%, while 802 diarrhea samples collected in 2017 and 964 samples collected in 2018 were positive at rates of 4.0% and 4.66% frequencies, respectively (healthy versus 2017-2018 combined diarrhea p-value of 0.05). None of 83 bloody diarrhea samples tested positive. Viral loads were generally low with average real-time PCR Ct values of 36 in all three positive groups. The species tropism and pathogenicity of cachavirus, the first chapparvovirus reported in feces of a placental carnivore, remains to be fully determined.