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背景この研究は、ネットワークの薬理学的分析を使用したアルツハイマー病(AD)の治療における、伝統的な漢方薬の処理型形成術の薬理学的標的と作用メカニズムを特定することを目的としています。ADの材料と方法ターゲットは、Disagenet Gene Discovery Platform、Herbal成分ターゲット(HIT)データベース、SuperPred、およびSwisStargetPrediction化合物ターゲット予測プラットフォームを使用して得られました。病原性および治療のターゲットをString Biological Databaseにインポートし、Cytoscape Network Integrationソフトウェアを使用して、コンポーネント標的および疾患標的相互作用ネットワークを構築しました。コアターゲットはトポロジー分析によって特定され、生物学的プロセスとシグナル伝達経路を特定するためにさらにテストされました。結果エストロゲン受容体α(ESR1)、ペルオキシソーム増殖因子活性化受容体ガンマ(PPARG)、腫瘍タンパク質P53(TP53)、SIRTUIN 1(SIRT1)、腫瘍壊死など、AD患者の治療におけるFormononetinの7つの重要な標的遺伝子が特定されました。因子(TNF)、シトクロムP450 19A1(CYP19A1)、および核因子(エリスロイド由来2) - 2(NFE2L2)。生物学的プロセスには、ホルモン代謝、ヌクレオシドの調節、ヌクレオチドおよび核酸代謝、アポトーシス、エネルギー経路、代謝、細胞コミュニケーション、およびシグナル伝達が含まれていました。シグナル伝達経路には、ヒストンのアセチル化と脱アセチル化(HDAC)クラスI、p38-alpha/ベータの調節、p38マイトジェン活性化プロテインキナーゼ(MAPK)シグナル伝達経路、骨形態形成タンパク質(BMP)受容体シグナル伝達、インタールーキン-1(IL1)を媒介するシグナル伝達イベント、腫瘍壊死因子(TNF)受容体シグナル伝達経路、細胞質および核SMAD2/3シグナル伝達。結論薬理学的ネットワーク分析を使用して、AD患者におけるフォームノネチン治療の遺伝子標的とメカニズムを特定しました。
背景この研究は、ネットワークの薬理学的分析を使用したアルツハイマー病(AD)の治療における、伝統的な漢方薬の処理型形成術の薬理学的標的と作用メカニズムを特定することを目的としています。ADの材料と方法ターゲットは、Disagenet Gene Discovery Platform、Herbal成分ターゲット(HIT)データベース、SuperPred、およびSwisStargetPrediction化合物ターゲット予測プラットフォームを使用して得られました。病原性および治療のターゲットをString Biological Databaseにインポートし、Cytoscape Network Integrationソフトウェアを使用して、コンポーネント標的および疾患標的相互作用ネットワークを構築しました。コアターゲットはトポロジー分析によって特定され、生物学的プロセスとシグナル伝達経路を特定するためにさらにテストされました。結果エストロゲン受容体α(ESR1)、ペルオキシソーム増殖因子活性化受容体ガンマ(PPARG)、腫瘍タンパク質P53(TP53)、SIRTUIN 1(SIRT1)、腫瘍壊死など、AD患者の治療におけるFormononetinの7つの重要な標的遺伝子が特定されました。因子(TNF)、シトクロムP450 19A1(CYP19A1)、および核因子(エリスロイド由来2) - 2(NFE2L2)。生物学的プロセスには、ホルモン代謝、ヌクレオシドの調節、ヌクレオチドおよび核酸代謝、アポトーシス、エネルギー経路、代謝、細胞コミュニケーション、およびシグナル伝達が含まれていました。シグナル伝達経路には、ヒストンのアセチル化と脱アセチル化(HDAC)クラスI、p38-alpha/ベータの調節、p38マイトジェン活性化プロテインキナーゼ(MAPK)シグナル伝達経路、骨形態形成タンパク質(BMP)受容体シグナル伝達、インタールーキン-1(IL1)を媒介するシグナル伝達イベント、腫瘍壊死因子(TNF)受容体シグナル伝達経路、細胞質および核SMAD2/3シグナル伝達。結論薬理学的ネットワーク分析を使用して、AD患者におけるフォームノネチン治療の遺伝子標的とメカニズムを特定しました。
BACKGROUND This study aimed to identify the pharmacological targets and mechanisms of action of the traditional Chinese medicine, formononetin, in the treatment of Alzheimer's disease (AD) using network pharmacological analysis. MATERIAL AND METHODS Targets of AD were obtained by using DisGeNET gene discovery platform, the herbal ingredients target (HIT) database, the SuperPred, and the SwissTargetPrediction compound target prediction platforms. Pathogenic and therapeutic targets were imported to the STRING biological database, and Cytoscape network integration software was used to construct component-target and disease-target interaction networks. Core targets were identified by topological analysis and were further tested to identify the biological processes and signaling pathways. RESULTS Seven key target genes for formononetin in the treatment of patients with AD were identified, including estrogen receptor alpha (ESR1), peroxisome proliferator-activated receptor gamma (PPARG), tumor protein p53 (TP53), sirtuin 1 (SIRT1), tumor necrosis factor (TNF), cytochrome P450 19A1 (CYP19A1), and nuclear factor (erythroid-derived 2)-like 2 (NFE2L2). The biological processes included hormone metabolism, regulation of nucleoside, nucleotide and nucleic acid metabolism, apoptosis, energy pathways, metabolism, cell communication, and signal transduction. The signaling pathways included histone acetylation and deacetylation (HDAC) class I, regulation of p38-alpha/beta, p38 mitogen-activated protein kinase (MAPK) signaling pathway, bone morphogenetic protein (BMP) receptor signaling, interleukin-1 (IL1) mediated signaling events, the tumor necrosis factor (TNF) receptor signaling pathway, and cytoplasmic and nuclear Smad2/3 signaling. CONCLUSIONS Pharmacological network analysis was used to identify the gene targets and mechanisms of formononetin treatment in patients with AD.
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