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サツマイモ（Ipomoea batatas [L.] lam。）は、サハラ以南のアフリカの重要な自給作物ですが、多くの作物と同様に、収量は干ばつストレスによって深刻な影響を受ける可能性があります。干ばつ耐性を制御する遺伝的メカニズムを理解することで、干ばつ耐性のサツマイモ品種の発達を促進することができます。ここでは、ポリエチレングリコール（PEG）で処理して干ばつをシミュレートし、ストレス後24時間および48時間でサンプリングしたタンザニアのウガンダのランドレースを使用して、米繁殖品種のボーリガードとタンザニアのウガンダの陸地を使用した発現プロファイリング研究を報告します。各時点で、葉組織の4,000〜6,000の遺伝子が各栽培品種で差次的に発現しました。これらの差次的に発現した遺伝子の約半分は、2つの品種間で一般的であり、干ばつ反応に関連する遺伝子オントロジーの用語で濃縮されました。モデル種で報告された干ばつ耐性遺伝子の300個のオーソログは、IPOMOEA Trifida参照ゲノムで同定されました。そのうち122は、干ばつ耐性候補遺伝子のリストを構成する少なくとも1つの実験的条件下で差次的に発現しました。遺伝子のサブセットは、ボーリガードとタンザニアの間で差別的に調節され、干ばつストレスに対する遺伝子型固有の反応を表しています。ここで報告されたデータは、サツマイモの干ばつ耐性遺伝子を特定し、利用するための遺伝学者とブリーダーにリソースを提供します。
サツマイモ（Ipomoea batatas [L.] lam。）は、サハラ以南のアフリカの重要な自給作物ですが、多くの作物と同様に、収量は干ばつストレスによって深刻な影響を受ける可能性があります。干ばつ耐性を制御する遺伝的メカニズムを理解することで、干ばつ耐性のサツマイモ品種の発達を促進することができます。ここでは、ポリエチレングリコール（PEG）で処理して干ばつをシミュレートし、ストレス後24時間および48時間でサンプリングしたタンザニアのウガンダのランドレースを使用して、米繁殖品種のボーリガードとタンザニアのウガンダの陸地を使用した発現プロファイリング研究を報告します。各時点で、葉組織の4,000〜6,000の遺伝子が各栽培品種で差次的に発現しました。これらの差次的に発現した遺伝子の約半分は、2つの品種間で一般的であり、干ばつ反応に関連する遺伝子オントロジーの用語で濃縮されました。モデル種で報告された干ばつ耐性遺伝子の300個のオーソログは、IPOMOEA Trifida参照ゲノムで同定されました。そのうち122は、干ばつ耐性候補遺伝子のリストを構成する少なくとも1つの実験的条件下で差次的に発現しました。遺伝子のサブセットは、ボーリガードとタンザニアの間で差別的に調節され、干ばつストレスに対する遺伝子型固有の反応を表しています。ここで報告されたデータは、サツマイモの干ばつ耐性遺伝子を特定し、利用するための遺伝学者とブリーダーにリソースを提供します。
Sweet potato (Ipomoea batatas [L.] Lam.) is an important subsistence crop in Sub-Saharan Africa, yet as for many crops, yield can be severely impacted by drought stress. Understanding the genetic mechanisms that control drought tolerance can facilitate the development of drought-tolerant sweet potato cultivars. Here, we report an expression profiling study using the US-bred cultivar, Beauregard, and a Ugandan landrace, Tanzania, treated with polyethylene glycol (PEG) to simulate drought and sampled at 24 and 48 hr after stress. At each time-point, between 4,000 to 6,000 genes in leaf tissue were differentially expressed in each cultivar. Approximately half of these differentially expressed genes were common between the two cultivars and were enriched for Gene Ontology terms associated with drought response. Three hundred orthologs of drought tolerance genes reported in model species were identified in the Ipomoea trifida reference genome, of which 122 were differentially expressed under at least one experimental condition, constituting a list of drought tolerance candidate genes. A subset of genes was differentially regulated between Beauregard and Tanzania, representing genotype-specific responses to drought stress. The data analyzed and reported here provide a resource for geneticists and breeders toward identifying and utilizing drought tolerance genes in sweet potato.
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