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Molecular ecology2019Aug01Vol.28issue(16)

野生の斑点のあるハイエナにおけるグローバルなDNAメチル化の幼少期の社会的および生態学的決定要因

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文献タイプ:
  • Journal Article
  • Research Support, N.I.H., Extramural
  • Research Support, Non-U.S. Gov't
  • Research Support, U.S. Gov't, Non-P.H.S.
概要
Abstract

環境要因の早い段階では、動物の発達と表現型に永続的な影響を与える可能性がありますが、根本的な分子修飾はよく理解されていません。ケニアのマサイマラ国立保護区(Crocuta crocuta)における293の野生の斑点のあるハイエナ(Crocuta crocuta)における幼少期の社会生態学的要因と世界のDNAメチル化の間の横断的関連を調べ、3つの年齢階級(Cub、Subadult、Adult)に基づいてグループ化されました。関心のある説明変数には、ダイアディックアゴニズムの相互作用、ごみのサイズ、野生の脱毛症の獲物密度、および各ハイエナが保護区の違法畜産の数に基づいて生まれた年の人為的妨害の結果に基づく年間母体ランクが含まれていました。関心のある従属変数は、ゲノム全体のCCGG部位で計算されたメチル化率を提供するルミノメトリックメチル化アッセイを介して評価されたグローバルなDNAメチル化でした。カブスの間では、低位の母親よりも生まれた子孫でCCGGメチル化が約2.75%高いことが観察されました。カブスとサブアダルトの中で、より高い人為的障害は、より高い%CCGGメチル化に対応していました。カブスと成人の両方で、ハイエナが3ヶ月前に測定された獲物密度と%CCGGメチル化との間に逆相関があることがわかりました。我々の結果は、母体のランク、人為的障害、および獲物の入手可能性が人生の早い段階で、後期の世界的なDNAメチル化に関連していることを示唆しています。将来の研究は、これらのDNAメチル化パターンが成人の表現型とフィットネスの結果に関連する程度を理解するために必要です。

環境要因の早い段階では、動物の発達と表現型に永続的な影響を与える可能性がありますが、根本的な分子修飾はよく理解されていません。ケニアのマサイマラ国立保護区(Crocuta crocuta)における293の野生の斑点のあるハイエナ(Crocuta crocuta)における幼少期の社会生態学的要因と世界のDNAメチル化の間の横断的関連を調べ、3つの年齢階級(Cub、Subadult、Adult)に基づいてグループ化されました。関心のある説明変数には、ダイアディックアゴニズムの相互作用、ごみのサイズ、野生の脱毛症の獲物密度、および各ハイエナが保護区の違法畜産の数に基づいて生まれた年の人為的妨害の結果に基づく年間母体ランクが含まれていました。関心のある従属変数は、ゲノム全体のCCGG部位で計算されたメチル化率を提供するルミノメトリックメチル化アッセイを介して評価されたグローバルなDNAメチル化でした。カブスの間では、低位の母親よりも生まれた子孫でCCGGメチル化が約2.75%高いことが観察されました。カブスとサブアダルトの中で、より高い人為的障害は、より高い%CCGGメチル化に対応していました。カブスと成人の両方で、ハイエナが3ヶ月前に測定された獲物密度と%CCGGメチル化との間に逆相関があることがわかりました。我々の結果は、母体のランク、人為的障害、および獲物の入手可能性が人生の早い段階で、後期の世界的なDNAメチル化に関連していることを示唆しています。将来の研究は、これらのDNAメチル化パターンが成人の表現型とフィットネスの結果に関連する程度を理解するために必要です。

Environmental factors early in life can have lasting influence on the development and phenotypes of animals, but the underlying molecular modifications remain poorly understood. We examined cross-sectional associations among early life socioecological factors and global DNA methylation in 293 wild spotted hyenas (Crocuta crocuta) in the Masai Mara National Reserve, Kenya, grouped according to three age classes (cub, subadult and adult). Explanatory variables of interest included annual maternal rank based on outcomes of dyadic agonistic interactions, litter size, wild ungulate prey density and anthropogenic disturbance in the year each hyena was born based on counts of illegal livestock in the Reserve. The dependent variable of interest was global DNA methylation, assessed via the LUminometric Methylation Assay, which provides a percentage methylation value calculated at CCGG sites across the genome. Among cubs, we observed approximately 2.75% higher CCGG methylation in offspring born to high- than low-ranking mothers. Among cubs and subadults, higher anthropogenic disturbance corresponded with greater %CCGG methylation. In both cubs and adults, we found an inverse association between prey density measured before a hyena was 3 months old and %CCGG methylation. Our results suggest that maternal rank, anthropogenic disturbance and prey availability early in life are associated with later life global DNA methylation. Future studies are required to understand the extent to which these DNA methylation patterns relate to adult phenotypes and fitness outcomes.

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