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BMC research notes2019Jul16Vol.12issue(1)

ケニアのナイロビにおける多剤耐性サルモネラenterica gerovar Typhi分離株のプラスミドプロファイリングと非互換性グループ化

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文献タイプ:
  • Journal Article
概要
Abstract

目的:プラスミドは、多剤耐性病原体の出現に寄与する抗生物質耐性遺伝子を抱えています。多剤耐性サルモネラエンテリカ血清型Typhi(S。Typhi)分離株におけるプラスミドの存在を以前の研究から検出し、その結果、それらの互換性グループと共役伝達の可能性を決定しました。プラスミドは、アルカリ性溶解技術に基づいて、98の多剤耐性S. Typhi分離株から抽出されました。プラスミドの非互換性グループ化は、18組のプライマーを使用してPCRレプリコンタイピングによって確立され、FIA、FIB、FIC、HI1、HI2、I1-Iγ、L/M、N、P、W、T、A/C、B/o、x、y、f、およびfiiaレプリコン。抗生物質耐性の表現型は、プラスミドを含むS. Typhi分離株から、プラスミドを欠いている大腸菌K12F株に結合しました。 結果:MDR S. Typhi分離株の約79.6%がプラスミドの存在に関連していました。非互換性(INC)グループHI1に属するプラスミドの93.6%を検出しました。特定された他の非互換性グループには、Incfic(16.7%)、Incp(1.3%)、およびInci1(1.3%)が含まれていました。MDR S. Typhi隔離は、非互換性グループHi1の相同プラスミドを運びました。そのほとんどは、アンピシリン、テトラサイクリン、クロラムフェニコールの耐性表現型をトランスジュガンに伝達しました。

目的:プラスミドは、多剤耐性病原体の出現に寄与する抗生物質耐性遺伝子を抱えています。多剤耐性サルモネラエンテリカ血清型Typhi(S。Typhi)分離株におけるプラスミドの存在を以前の研究から検出し、その結果、それらの互換性グループと共役伝達の可能性を決定しました。プラスミドは、アルカリ性溶解技術に基づいて、98の多剤耐性S. Typhi分離株から抽出されました。プラスミドの非互換性グループ化は、18組のプライマーを使用してPCRレプリコンタイピングによって確立され、FIA、FIB、FIC、HI1、HI2、I1-Iγ、L/M、N、P、W、T、A/C、B/o、x、y、f、およびfiiaレプリコン。抗生物質耐性の表現型は、プラスミドを含むS. Typhi分離株から、プラスミドを欠いている大腸菌K12F株に結合しました。 結果:MDR S. Typhi分離株の約79.6%がプラスミドの存在に関連していました。非互換性(INC)グループHI1に属するプラスミドの93.6%を検出しました。特定された他の非互換性グループには、Incfic(16.7%)、Incp(1.3%)、およびInci1(1.3%)が含まれていました。MDR S. Typhi隔離は、非互換性グループHi1の相同プラスミドを運びました。そのほとんどは、アンピシリン、テトラサイクリン、クロラムフェニコールの耐性表現型をトランスジュガンに伝達しました。

OBJECTIVES: Plasmids harbour antibiotic resistance genes which contribute to the emergence of multidrug resistant pathogens. We detected the presence of plasmids in multidrug resistant Salmonella enterica serovar Typhi (S. Typhi) isolates from our previous study and consequently determined their incompatibility groups and possibility of conjugation transmission. Plasmids were extracted from 98 multidrug resistant S. Typhi isolates based on alkaline lysis technique. Plasmid incompatibility grouping was established by PCR replicon typing using 18 pairs of primers to amplify FIA, FIB, FIC, HI1, HI2, I1-Iγ, L/M, N, P, W, T, A/C, K, B/O, X, Y, F and FIIA replicons. Antibiotic resistance phenotypes were conjugally transferred from S. Typhi isolates with plasmids to Escherichia coli K12F strain devoid of plasmids. RESULTS: Approximately 79.6% of the MDR S. Typhi isolates were related to the existence of plasmids. We detected 93.6% of plasmids belonging to incompatibility (Inc) group HI1. The other incompatibility groups identified included IncFIC (16.7%), IncP (1.3%), and IncI1 (1.3%) which appeared together with Inc HI1. MDR S. Typhi isolated carried a homologous plasmid of incompatibility group HI1 most of which transferred the resistance phenotypes of ampicillin, tetracycline and chloramphenicol to the transconjugants.

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