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Upland Cotton（Gossypium hirsutum L.）は、世界で最も重要な天然繊維の供給源です。早期の高地の綿の品種は、一般的に中国に植えられています。それにもかかわらず、早期大衆式の高地綿の品種の糸くずの収量は、中間および後期の大物の綿の品種よりも著しく低い。早期成熟した綿の糸くずの収量を効果的に改善する方法は、綿研究の焦点となります。ここでは、160の早期発生の高地綿媒介の72,792の高品質の単一ヌクレオチド多型に基づいて、Lintパーセンテージ（LP）のゲノム全体の関連研究（GWASS）を実行し、1つの単一焦点法と6つの多ロカス方法を適用しました。合計4および45の有意な定量的特性ヌクレオチド（QTN）が、LPに関連することがそれぞれ特定されました。興味深いことに、4つの植栽環境のうち2つでは、これらのQTNのうち2つ（A02_74713290およびA02_75551547）が同時に、1つの単一焦点と3つ以上のマルチロカスGWASメソッドの両方を介して検出されました。上記の2つのピークQTNS、GH_A02G1269、GH_A02G1280、およびGH_A02G1295を含むゲノム領域内の42の遺伝子（A02：74.31-75.95 MBP）の中で、GH_A02G1278からの種子の発達中の卵巣の発達中の卵巣の発現が最高の発現レベルが最も高かった。他の臓器ではなく繊維で発現します。これらの結果は、4つの潜在的な候補遺伝子が、種子の体重と繊維収量の割合を調節することにより、綿LPと密接に関連している可能性があることを意味します。この研究で特定されたLPのQTNと潜在的な候補遺伝子は、将来の入会性と糸くずの収量を伴う新しい綿の品種を育てるための貴重なリソースを提供します。
Upland Cotton（Gossypium hirsutum L.）は、世界で最も重要な天然繊維の供給源です。早期の高地の綿の品種は、一般的に中国に植えられています。それにもかかわらず、早期大衆式の高地綿の品種の糸くずの収量は、中間および後期の大物の綿の品種よりも著しく低い。早期成熟した綿の糸くずの収量を効果的に改善する方法は、綿研究の焦点となります。ここでは、160の早期発生の高地綿媒介の72,792の高品質の単一ヌクレオチド多型に基づいて、Lintパーセンテージ（LP）のゲノム全体の関連研究（GWASS）を実行し、1つの単一焦点法と6つの多ロカス方法を適用しました。合計4および45の有意な定量的特性ヌクレオチド（QTN）が、LPに関連することがそれぞれ特定されました。興味深いことに、4つの植栽環境のうち2つでは、これらのQTNのうち2つ（A02_74713290およびA02_75551547）が同時に、1つの単一焦点と3つ以上のマルチロカスGWASメソッドの両方を介して検出されました。上記の2つのピークQTNS、GH_A02G1269、GH_A02G1280、およびGH_A02G1295を含むゲノム領域内の42の遺伝子（A02：74.31-75.95 MBP）の中で、GH_A02G1278からの種子の発達中の卵巣の発達中の卵巣の発現が最高の発現レベルが最も高かった。他の臓器ではなく繊維で発現します。これらの結果は、4つの潜在的な候補遺伝子が、種子の体重と繊維収量の割合を調節することにより、綿LPと密接に関連している可能性があることを意味します。この研究で特定されたLPのQTNと潜在的な候補遺伝子は、将来の入会性と糸くずの収量を伴う新しい綿の品種を育てるための貴重なリソースを提供します。
Upland cotton (Gossypium hirsutum L.) is the most important source of natural fiber in the world. Early-maturity upland cotton varieties are commonly planted in China. Nevertheless, lint yield of early-maturity upland cotton varieties is strikingly lower than that of middle- and late-maturity ones. How to effectively improve lint yield of early maturing cotton, becomes a focus of cotton research. Here, based on 72,792 high-quality single nucleotide polymorphisms of 160 early-maturing upland cotton accessions, we performed genome-wide association studies (GWASs) for lint percentage (LP), one of the most lint-yield component traits, applying one single-locus method and six multi-locus methods. A total of 4 and 45 significant quantitative trait nucleotides (QTNs) were respectively identified to be associated with LP. Interestingly, in two of four planting environments, two of these QTNs (A02_74713290 and A02_75551547) were simultaneously detected via both one single-locus and three or more multi-locus GWAS methods. Among the 42 genes within a genomic region (A02: 74.31-75.95 Mbp) containing the above two peak QTNs, Gh_A02G1269, Gh_A02G1280, and Gh_A02G1295 had the highest expression levels in ovules during seed development from 20 to 25 days post anthesis, whereas Gh_A02G1278 was preferentially expressed in the fibers rather than other organs. These results imply that the four potential candidate genes might be closely related to cotton LP by regulating the proportion of seed weight and fiber yield. The QTNs and potential candidate genes for LP, identified in this study, provide valuable resource for cultivating novel cotton varieties with earliness and high lint yield in the future.
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