成人の急性骨髄性白血病でFIP1L1_PDGFRAを生成する複雑で染色性染色体内再配置

PdGFRA遺伝子の好酸球および異常を伴う骨髄性新生物は、チロシンキナーゼ阻害剤の治療から利益を得ることができるため、治療の最良の選択を確保するためにPDGFRAの再編成を明らかにすることが不可欠です。最も一般的なPDGFRAパートナーはFIP1L1遺伝子であり、腫瘍タンパク質FIP1L1/PDGFRA（F/P）を生成します。ほとんどの場合、F/P融合遺伝子は、バンド4Q12の染色体内再配置に由来し、時には染色体転座に由来します。どちらの場合も、Chic2遺伝子が関与する領域の間質性染色体欠失が報告されています。これは、従来の核型解析によって不可解ですが、蛍光in situハイブリダイゼーション（FISH）分析によって検出可能です。ここでは、好酸球性を呈する急性骨髄性白血病（AML）症例を報告します。F/P融合遺伝子は、4Q12の新しい染色で複雑なクロモソーム内層状化に由来しました。古典的な魚のアッセイは異常なハイブリダイゼーションシグナルを明らかにしましたが、F/Pキマリック遺伝子の存在は分子分析によって実証されました。骨髄性遺伝子パネルを使用した染色体再編成の分子特性と標的次世代シーケンス（NGS）分析を実施し、TET2およびETV6遺伝子に影響を与える病原性ゲノム変異体の存在を明らかにしました。これらの変異は、疾患の発症時にサブクローンとして存在し、再発時にクローンサイズが増加しました。

Myeloid neoplasms with eosinophilia and abnormalities of the PDGFRA gene can benefit from therapy with tyrosine kinase inhibitors, therefore revealing the PDGFRA rearrangement is essential to ensure the best choice of treatment. The most common PDGFRA partner is the FIP1L1 gene, generating the oncoprotein FIP1L1/PDGFRA (F/P). In the majority of cases the F/P fusion gene originates from intrachromosomal rearrangement at band 4q12, and occasionally from chromosomal translocations. In both cases, the interstitial chromosomal deletion of a region involving the CHIC2 gene has been reported, which is cryptic by conventional karyotyping but detectable by Fluorescence In Situ Hybridization (FISH) analyses. Herein, we report an acute myeloid leukemia (AML) case presenting with eosinophilia; the F/P fusion gene originated from a new, cryptic and complex intrachromosomal rearrangement of 4q12. Classical FISH assay revealed abnormal hybridization signals, but the presence of the F/P chimaeric gene was demonstrated by molecular analysis. We performed molecular characterization of the chromosomal rearrangement and targeted Next-Generation Sequencing (NGS) analysis with a myeloid gene panel, revealing the presence of pathogenic genomic variants affecting the TET2 and ETV6 genes. These mutations were present as subclones at the disease onset and their clone size increased at relapse.