ヒトオパールサプレッサーTRNA遺伝子と偽遺伝子

バクテリオファージラムダでクローン化されたヒトDNAライブラリーは、オパールサプレッサーTRNAプローブでスクリーニングされました。2つの遺伝子を分離し、PBR322にサブクローニングし、配列決定しました。1つは、介在シーケンスなしの長さが正常なオパール抑制tRNA遺伝子87ヌクレオチドです。成熟したtRNAが終端コドンUGAを読み取ることを実証するTCAアンチコドンがあります。転写用の5 '内部制御領域には、3'内部制御領域は正常である一方で、真正性TRNA遺伝子のコンセンサス配列と比較して2つの余分なヌクレオチドがあります。この遺伝子は、以前にシーケンスされた鶏のオパールサプレッサーセリンTRNA遺伝子（Hatfield、D.、Dudock、B。、およびEden、F。（1983）Proc。Acad。Sci。M.S.A.80、4940-4944）とは異なります。11. 2番目のヒト遺伝子は、成熟したtRNAのクローバー葉の形態には、アクセプターステムに3つの非複製塩基があるため、3 '端の近くで切り捨てられた偽遺伝子であるように見えます。2つのヒト遺伝子は高度な相同性を持ち、擬似遺伝子の切り捨てられた3 '末端を除外して、2つの位置のみで異なります。擬似遺伝子の隣接配列は、繰り返されるシーケンスのヒトALUファミリーのコンセンサスシーケンスと約90％相同です。この遺伝子は、2人の隣接するALUファミリーメンバーの間に挿入されたようです。

A human DNA library, cloned in bacteriophage lambda, was screened with an opal suppressor tRNA probe. Two genes were isolated, subcloned into pBR322, and sequenced. One is a normal opal suppressor tRNA gene 87 nucleotides in length without intervening sequences. It has a TCA anticodon demonstrating that the mature tRNA reads the termination codon UGA. The 5' internal control region for transcription has two extra nucleotides compared to the consensus sequence for eucaryotic tRNA genes, while the 3' internal control region is normal. This gene differs from a previously sequenced chicken opal suppressor serine tRNA gene (Hatfield, D., Dudock, B., and Eden, F. (1983) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 80, 4940-4944) only at position 11. The second human gene appears to be a pseudogene truncated near the 3' end, since in the cloverleaf form of the mature tRNA there are three noncomplementary bases in the acceptor stem. The two human genes have a high degree of homology and, excluding the truncated 3' terminus of the pseudogene, differ in only two positions. The flanking sequences of the pseudogene are about 90% homologous to the consensus sequence of the human Alu family of repeated sequences. This gene appears to have been inserted between two adjacent Alu family members.