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代謝ネットワークは、「遺伝子」から始まり、セルの「表現型」(観察可能な関数)で終わる情報の流れのエンドポイントです。以前は、細胞内で分析されたさまざまな代謝産物のために、複数の細胞を含むサンプルでメタボロミクス測定が実行されました。残念ながら、このサンプリングプロセスは、細胞間から細胞間の不均一性などの重要な代謝現象を隠す可能性があります。これらの研究では、単一細胞の感度で再現性のある結果を堅牢に提供できる分析手法を使用する必要があります。この章では、シングルセル分析のためのレーザーベースの方法と、質量分析(またはMAM)のマイクロアレイの新しいアプローチについて詳細に説明します。この特定のタイプのマイクロアレイは、光学およびレーザー脱着/イオン化(LDI)またはMALDI質量分析などの多分析的な読み出しを使用して、液体培地で成長した細胞の研究に合わせて調整されました。
代謝ネットワークは、「遺伝子」から始まり、セルの「表現型」(観察可能な関数)で終わる情報の流れのエンドポイントです。以前は、細胞内で分析されたさまざまな代謝産物のために、複数の細胞を含むサンプルでメタボロミクス測定が実行されました。残念ながら、このサンプリングプロセスは、細胞間から細胞間の不均一性などの重要な代謝現象を隠す可能性があります。これらの研究では、単一細胞の感度で再現性のある結果を堅牢に提供できる分析手法を使用する必要があります。この章では、シングルセル分析のためのレーザーベースの方法と、質量分析(またはMAM)のマイクロアレイの新しいアプローチについて詳細に説明します。この特定のタイプのマイクロアレイは、光学およびレーザー脱着/イオン化(LDI)またはMALDI質量分析などの多分析的な読み出しを使用して、液体培地で成長した細胞の研究に合わせて調整されました。
The metabolic network is the endpoint in the flow of information that begins with the "gene" and ends with "phenotype" (observable function) of the cell. Previously, due to the variety of metabolites analyzed inside cells, the metabolomic measurements were performed with samples including multiple cells. Unfortunately, this sampling process may mask important metabolic phenomena, such as cell-to-cell heterogeneity. For these studies, we must use analytical techniques that can robustly deliver reproducible results with single-cell sensitivity. In this chapter, we summarize laser-based methods for single-cell analysis and a novel approach of MicroArrays for Mass Spectrometry (or MAMS) is described in full detail. This particular type of microarrays was tailored for the study of cells grown in liquid medium using multiple-analytical read-outs, such as optical and laser desorption/ionization (LDI) or MALDI mass spectrometry.
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