味に関連する遺伝子の遺伝的変異と膵臓癌のリスク

膵管腺癌は、5年の生存率と明確な遺伝的背景を伴う攻撃的で比較的まれな癌です。味覚受容体と味に関連する遺伝子の遺伝的変異は、いくつかの癌タイプと膵臓癌の危険因子を含むさまざまなヒト特性と表現型に関連しています。この研究では、37の味覚受容体を含む50の味関連遺伝子で2854の単一ヌクレオチド多型を分析しました。選択された遺伝子のすべての遺伝的変動をカバーし、調節要素も含めるために、各遺伝子の両端に5000ヌクレオチドを追加しました。Panscanデータセット（3314症例および3431コントロール）を発見フェーズとして、PANC4（3893症例および3632コントロール）を検証フェーズとして使用し、合計7207件と7063のコントロールを使用して、2相アプローチを使用しました。データセットは、遺伝子型と表現型（DBGAP）のNCBIデータベースからダウンロードされました。Taste 1受容体メンバー2（TAS1R2）-RS11261087バリアントは、両方のフェーズで独立して膵臓癌リスクと関連しており、T対立遺伝子と疾患の発症リスクの減少と一貫した関連性があることが観察されました[フェーズ1オッズ比（OR）= = = = =0.89、95％信頼区間（CI）0.80-0.98;フェーズ2または= 0.91、95％CI 0.83-0.99;すべての被験者が一緒になっているOR = 0.90、95％CI 0.84-0.96、p = 0.002]。ただし、検証段階で観察された関連性も、共同分析で観察された関連も、複数のテストを考慮して統計的に有意ではありませんでした。PDACリスクに対するTAS1R2の遺伝的変動性の影響をよりよく理解するために、機能的研究が保証されています。

Pancreatic ductal adenocarcinoma is an aggressive and relatively rare cancer with a dismal 5-year survival rate and a clear genetic background. Genetic variants in taste receptors and taste-related genes have been associated with a variety of human traits and phenotypes among which several cancer types and pancreatic cancer risk factors. In this study, we analysed 2854 single-nucleotide polymorphisms in 50 taste-related genes, including 37 taste receptors. To cover all the genetic variability of the selected genes and to include also regulatory elements, we added 5000 nucleotides to both ends of each gene. We used a two-phase approach, with the PanScan data set (3314 cases and 3431 controls) as the discovery phase and PanC4 (3893 cases and 3632 controls) as validation phase, for a total of 7207 cases and 7063 controls. The datasets were downloaded from the NCBI database of genotypes and phenotypes (dbGaP). We observed that the taste 1 receptor member 2 (TAS1R2)-rs11261087 variant was associated with pancreatic cancer risk in both phases independently, with a consistent association of the T allele with decreased risk of developing the disease [phase 1 odds ratio (OR) = 0.89, 95% confidence interval (CI) 0.80-0.98; phase 2 OR = 0.91, 95% CI 0.83-0.99; all subjects together OR = 0.90, 95% CI 0.84-0.96, P = 0.002]. However, neither the association observed in the validation phase nor those observed in the joint analysis were statistically significant considering multiple testing. Functional studies are warranted to better understand the impact of the genetic variability of TAS1R2 on PDAC risk.