ウイルスDNAキャプチャー - スケクアプローチによって分析された自然感染した個人におけるHTLV-1プロビラの性質

レトロウイルスヒトT細胞白血病ウイルス1型（HTLV-1）は、宿主DNAに統合され、持続性感染を達成し、ヒト疾患を誘導します。ここでは、ウイルスDNAキャプチャシーケンス（DNAキャプチャー-Seq）が、自然ウイルス感染者のHTLV-1プロウイルスを特徴付け、プロビラル構造とウイルス統合部位に関する包括的な情報を提供するのに役立つことを実証します。自然にHTLV-1感染者98人の末梢血を分析し、白血病患者だけでなく、他の臨床団体の患者にも欠陥のあるプロミュラスが存在することを発見しました。さらに、欠陥型のプロミュロースを持つクローンが、フルレングスのプロミュラスを持つものよりも高い程度のクローン存在量を示すことを実証しました。HTLV-1感染ヒトマウスにおける欠陥型プロミュラスの頻度は、感染した人のそれよりも低く、感染の初期段階では欠陥のあるプロミスがまれであるが、持続性感染中に優先的に選択されたことを示しています。これらの結果は、HTLV-1感染に対するウイルスDNAキャプチャー-Seqの堅牢性を示し、ヒトの他のウイルス関連癌に対する潜在的な応用を示唆しています。

The retrovirus human T-cell leukemia virus type 1 (HTLV-1) integrates into the host DNA, achieves persistent infection, and induces human diseases. Here, we demonstrate that viral DNA-capture sequencing (DNA-capture-seq) is useful to characterize HTLV-1 proviruses in naturally virus-infected individuals, providing comprehensive information about the proviral structure and the viral integration site. We analyzed peripheral blood from 98 naturally HTLV-1-infected individuals and found that defective proviruses were present not only in patients with leukemia, but also in those with other clinical entities. We further demonstrated that clones with defective-type proviruses exhibited a higher degree of clonal abundance than those with full-length proviruses. The frequency of defective-type proviruses in HTLV-1-infected humanized mice was lower than that in infected individuals, indicating that defective proviruses were rare at the initial phase of infection but preferentially selected during persistent infection. These results demonstrate the robustness of viral DNA-capture-seq for HTLV-1 infection and suggest potential applications for other virus-associated cancers in humans.