新生児集中治療室におけるバチルスセレウス感染症のクラスター：疫学的および全ゲノムシーケンス分析

新生児集中治療室で発生するセレウス分離株は、全ゲノムシーケンスを使用して調査されました。アウトブレイクは、新生児集中治療室に隣接して行われた建設作業と一致し、建設エリアの厳格な封印の後に停止しました。発生はポリクローナルであることがわかりましたが、クローン性はin vivoの病原性と相関していませんでした。遺伝子型で類似した分離株は、致死/重度の感染とコロニー形成/環境汚染の両方に関連していた。環境細菌の負荷は、特にリスクの高い患者において、感染の主要な決定要因である可能性があります。臨床医は、臨床培養からのB. cereusの分離の異常な増加に注意を払う必要があります。古典的な感染症の仕事にゲノミクスを統合することで、病原体伝達と病原性の理解を高めることができ、異常な疾患の傾向に対する反応を迅速に支援することができます。

Bacillus cereus isolates causing an outbreak in the neonatal intensive care unit were investigated using whole-genome sequencing. The outbreak coincided with construction work performed adjacent to the neonatal intensive care unit and ceased after strict sealing of the construction area. We found the outbreak to be polyclonal, however, the clonality did not correlate with the virulence in vivo. Genotypically similar isolates were associated with both lethal/severe infection and colonization/environmental contamination. Environmental bacterial load may be a major determinant of infection, especially in high-risk patients. Clinicians should be alert to unusual increase in B. cereus isolations from clinical cultures to facilitate early recognition and investigations of Bacillus outbreaks and pseudo-outbreaks. The integration of genomics into the classical infectious disease work can augment our understanding of pathogen transmission and virulence, and can rapidly assist our response to unusual disease trends.