ヒトOSBPL2オーソログの非存在下での聴覚OC-1細胞とゼブラフィッシュの内耳組織の比較トランスクリプトーム分析

私たちの以前の研究では、オキシステロール結合タンパク質関連タンパク質2（OSBPL2）が最初に新しい難聴の発生遺伝子が非シンクロミック難聴に寄与すると特定されました。ただし、OSBPL2誘導の難聴の基礎となるメカニズムは不明のままです。ここでは、聴覚特異的細胞と組織を使用し、ゼブラフィッシュの内耳組織をモデルとして使用して、RNA-seq分析によるヒトOSBPL2オーソログの非存在下での遺伝子および経路の一般的なトランスクリプトームの変化を特定しました。合計で、2112個の差次的に発現した遺伝子（deg）が野生型（WT）とOSBPL2 - / - OC-1Cellsの間で同定され、WTとOSBPL2B - / - ゼブラフィッシュの内耳組織の間で877度が同定されました。機能的注釈は、脂質代謝、細胞接着、およびOC-1cellとゼブラフィッシュの内耳組織の両方の細胞外マトリックスにosbpl2/osbpl2bを関与させました。タンパク質間相互作用（PPI）分析により、OSBPL2/OSBPL2Bがユビキチン化にも関与していることが示されました。さらなる実験により、OSBPL2 - / - OC-1細胞が、阻害されたFAK活性と細胞接着障害を特徴とする異常な焦点接着形態を示すことが示されました。結論として、OSBPL2オーソログによって調節された新規経路を特定し、OSBPL2欠乏によって誘発される難聴のメカニズムに関する新しい洞察を提供しました。

In our previous study, Oxysterol-binding protein-related protein 2 (OSBPL2) was first identified as a new deafness-causative gene contribute to non-syndromic hearing loss. However, the underlying mechanism of OSBPL2-induced hearing loss remains unknown. Here, we used hearing-specific cells and tissues OC-1 cells and zebrafish inner ear tissues as models to identify common transcriptome changes in genes and pathways in the absence of human OSBPL2 orthologues by RNA-seq analysis. In total, 2112 differentially expressed genes (DEGs) were identified between wild-type (WT) and Osbpl2-/- OC-1 cells, and 877 DEGs were identified between WT and osbpl2b-/- zebrafish inner ear tissues. Functional annotation implicated Osbpl2/osbpl2b in lipid metabolism, cell adhesion and the extracellular matrix in both OC-1 cells and zebrafish inner ear tissues. Protein-protein interaction (PPI) analysis indicated that Osbpl2/osbpl2b were also involved in ubiquitination. Further experiments showed that Osbpl2-/- OC-1 cells exhibited an abnormal focal adhesion morphology characterized by inhibited FAK activity and impaired cell adhesion. In conclusion, we identified novel pathways modulated by OSBPL2 orthologues, providing new insight into the mechanism of hearing loss induced by OSBPL2 deficiency.