7,8-ジヒドロ-8-オキソグアノシン病変は、テオフィリンアプタマーを阻害するか、その選択性を変化させる

アプタマーは、ターゲットに対する親和性/選択性が高いため、魅力的な構成要素です。ここでは、「RNAアルファベット」を拡張するために、その独自のH結合機能（Watson-CrickまたはHoogsteen）の一部であるため、7,8-ジヒドロ-8-オキソグアノシン（8-オキソグ）が使用されています。テオフィリンRNAアプタマーへの影響は、G11、G25、またはG26の位置で結合ポケットを変更することにより調査されました。RNase AとT1を使用した構造プロービングは、G11での変更が劇的な構造変化をもたらすことを示し、G25-/G26修飾類似体は標準的な構造と同様の切断パターンを示したことが示されました。次に、3つのキサンチン誘導体に向けた認識特性を、熱恐怖症を介して調査しました。位置G11でアプタマーを変更すると、結合阻害が生じました。ただし、G25での修飾は、テオブロミンに対する選択性を変化させ（Kd≈160μm）、テオフィリン（Kd> 1.5 mm）に対する親和性が観察されました。全体として、8-oxogは位置に依存する方法でアプタマーの構造に影響を与える可能性があり、ターゲット選択性の変化につながります。

Aptamers are attractive constructs due to their high affinity/selectivity towards a target. Here 7,8-dihydro-8-oxoguanosine (8-oxoG) has been used, due in part to its unique H-bonding capabilities (Watson-Crick or Hoogsteen), to expand the "RNA alphabet". Its impact on the theophylline RNA aptamer was explored by modifying its binding pocket at positions G11, G25, or G26. Structural probing, with RNases A and T1 , showed that modification at G11 leads to a drastic structural change, whereas the G25-/G26-modified analogues exhibited cleavage patterns similar to that of the canonical construct. The recognition properties towards three xanthine derivatives were then explored through thermophoresis. Modifying the aptamer at position G11 led to binding inhibition. Modification at G25, however, changed the selectivity towards theobromine (Kd ≈160 μm), with a poor affinity for theophylline (Kd >1.5 mm) being observed. Overall, 8-oxoG can have an impact on the structures of aptamers in a position-dependent manner, leading to altered target selectivity.