プロモーターの長さは、in vitroでT7 RNAポリメラーゼの開始に影響します：プロモーター/ポリメラーゼの共進化への新しい洞察

ポリメラーゼは遺伝子発現の不可欠な因子であり、遺伝情報の維持と伝播に不可欠です。RNAポリメラーゼ（RNAP）は、他のポリメラーゼとは異なり、プロモーター配列を結合して転写De novoを開始できるという点で、このプロモーター認識にはポリメラーゼに特定のDNA結合ドメインが存在する必要があります。バクテリオファージT7 RNAポリメラーゼ（T7RNAP）は、バクテリオファージとミトコンドリアRNAPを含む単一サブユニットRNAポリメラーゼのプロトタイプであり、T7 RNAPによる転写の構造と機構的側面はよく特徴付けられています。ここでは、プロトタイプT7 RNAPがミトコンドリアプロモーターと同様の切り捨てられたプロモーターを認識して開始できるかどうかを判断する実験について説明します。in vitroオリゴヌクレオチド転写系を使用して、T7 RNAPによる転写開始活性を分析しました。これらのアッセイは、切り捨てられたプロモーターに対する従来のde novo開始の限界を定義しただけでなく、RNA合成の開始の新しい活性を特定しました。これらの新しい活動は、プライマーを使用した単一サブユニットポリメラーゼ開始の移行から、プロモーターを使用したnovo開始への移行から生き残る痕跡活動である可能性があることを提案します。

Polymerases are integral factors of gene expression and are essential for the maintenance and transmission of genetic information. RNA polymerases (RNAPs) differ from other polymerases in that they can bind promoter sequences and initiate transcription de novo and this promoter recognition requires the presence of specific DNA binding domains in the polymerase. Bacteriophage T7 RNA polymerase (T7RNAP) is the prototype for single subunit RNA polymerases which include bacteriophage and mitochondrial RNAPs, and the structure and mechanistic aspects of transcription by T7 RNAP are well characterized. Here, we describe experiments to determine whether the prototype T7 RNAP is able to recognize and initiate at truncated promoters similar to mitochondrial promoters. Using an in vitro oligonucleotide transcriptional system, we have assayed transcription initiation activity by T7 RNAP. These assays have not only defined the limits of conventional de novo initiation on truncated promoters, but have identified novel activities of initiation of RNA synthesis. We propose that these novel activities may be vestigial activities surviving from the transition of single subunit polymerase initiation using primers to de novo initiation using promoters.