Pangenomics Come of Age：Bacteriaから植物や動物の応用まで

パンゲノームは、単一の個人ではなく、種または集団全体に見られるゲノム配列のコレクションを指します。シーケンスは、すべての個人に存在するコア、または個人のサブセットにのみサブセットに見られるアクセサリー（可変または分配可能）に存在する可能性があります。パンゲノム研究は細菌種で最初に実施されましたが、ゲノムシーケンスと組み立てアプローチの開発により、2つの大規模なヒトパンゲノムプロジェクトを含む真核生物、菌、植物、動物のパンゲノムの構築が可能になりました。これらのパンゲノムの分析により、多様な進化の歴史に由来する可能性が最も高いだけでなく、驚くべき類似点に起因する重要な違いが明らかになりました。

The pangenome refers to a collection of genomic sequence found in the entire species or population rather than in a single individual; the sequence can be core, present in all individuals, or accessory (variable or dispensable), found in a subset of individuals only. While pangenomic studies were first undertaken in bacterial species, developments in genome sequencing and assembly approaches have allowed construction of pangenomes for eukaryotic organisms, fungi, plants, and animals, including two large-scale human pangenome projects. Analysis of the these pangenomes revealed key differences, most likely stemming from divergent evolutionary histories, but also surprising similarities.