パイソン中のニドウイルスの存在に関する調査

背景：肺炎と口内炎は、さまざまな飼育下ヘビの重度でしばしば致命的な病気を表しています。細菌感染症は別として、paramyxo-、adeno-、reo、およびarenavirusはこれらの疾患を引き起こします。2014年、新しいウイルスがPythonsの肺炎の原因として登場しました。いくつかの出版物では、ボールパイソンとタイガーパイソンの肺炎に関連してニドウイルスが報告されています。ウイルスは、死んだ動物の臓器組織からの新しいシーケンス方法を使用して発見されました。 方法：重度の肺炎と口内炎は、緑の木のパイソンの飼育繁殖コレクションで高い死亡率をもたらしました。偏りのない深いシーケンスは、ニドウイルスシーケンスの検出につながります。開発されたRT-QPCRを使用して、メタゲノムの結果を確認し、このウイルスの重要性を判断しました。健康なコントロールだけでなく、呼吸器疾患に苦しんでいる動物を含む合計1554種類のボイドヘビがニドウイルスのスクリーニングを受けました。さらに、2つのフルレングス配列に加えて、異なるヘビ種から部分的な配列が生成されました。 結果：組み立てられたフルレングスヘビニドウイルスゲノムは、他の公開されているヘビニドウイルスと66.9％未満の全体的なゲノム配列同一性のみを共有し、新しい部分配列は99.89から79.4％の間で変化します。肺サンプルで最も高いウイルス量が検出されました。ヘビニドウイルスは、病気の動物だけでなく、典型的な臨床徴候を示さないヘビにも存在していました。 結論：私たちの発見は、呼吸器疾患におけるヘビニドウイルスの重要性の可能性をさらに強調し、さまざまな疾患の可能性を秘めた複数の循環株を証明しています。臨床的健康な個人におけるニドウイルス検出は、インキュベーション期間または回収率中の検査を表す可能性があります。私たちの調査では、パイソンにおけるニドウイルス感染の新しい側面が示されています。ニドウイルスは、病気の爬虫類の日常的な診断精密検査に含めるべきです。

BACKGROUND: Pneumonia and stomatitis represent severe and often fatal diseases in different captive snakes. Apart from bacterial infections, paramyxo-, adeno-, reo- and arenaviruses cause these diseases. In 2014, new viruses emerged as the cause of pneumonia in pythons. In a few publications, nidoviruses have been reported in association with pneumonia in ball pythons and a tiger python. The viruses were found using new sequencing methods from the organ tissue of dead animals. METHODS: Severe pneumonia and stomatitis resulted in a high mortality rate in a captive breeding collection of green tree pythons. Unbiased deep sequencing lead to the detection of nidoviral sequences. A developed RT-qPCR was used to confirm the metagenome results and to determine the importance of this virus. A total of 1554 different boid snakes, including animals suffering from respiratory diseases as well as healthy controls, were screened for nidoviruses. Furthermore, in addition to two full-length sequences, partial sequences were generated from different snake species. RESULTS: The assembled full-length snake nidovirus genomes share only an overall genome sequence identity of less than 66.9% to other published snake nidoviruses and new partial sequences vary between 99.89 and 79.4%. Highest viral loads were detected in lung samples. The snake nidovirus was not only present in diseased animals, but also in snakes showing no typical clinical signs. CONCLUSIONS: Our findings further highlight the possible importance of snake nidoviruses in respiratory diseases and proof multiple circulating strains with varying disease potential. Nidovirus detection in clinical healthy individuals might represent testing during the incubation period or reconvalescence. Our investigations show new aspects of nidovirus infections in pythons. Nidoviruses should be included in routine diagnostic workup of diseased reptiles.