アセチル化および定量化のためのライスヒストンプロピオニル化と化学誘導体の合成H3およびH4ペプチドの生成

ヒストンタンパク質は、遺伝子発現の調節における幅広い意味のため、クロマチンのダイナミクスの研究において重要です。ヒストンの修飾は、転写因子やコアクチベーターなどの関連するタンパク質と協調して、これらの調節プロセスに不可欠です。ヒストンタンパク質の分析を強化するために利用可能な生化学的技術の1つは、無水症状を使用した化学誘導体です。このプロトコルでは、酸抽出ヒストンをイネから効率的に誘導するためのプロピオニル化の使用について説明します。また、H3およびH4のトリプシンペプチドを合成し、ターゲットマス分析を使用した識別と定量化を支援するために、誘導体化された抽出ペプチドの性質を模倣します。ここでは、前駆体イオンの質量と各合成ペプチドの保持時間（RT）を利用できるようにします。これらは、ヒストンデータ分析を促進するための有用な情報を提供します。最後に、これらの合成ペプチドは、アッセイとさらなる実験研究のためにそれらを利用したい人にナノモル濃度（NM）濃度で分布することに注意します。

Histone proteins are crucial in the study of chromatin dynamics owing to their wide-ranging implications in the regulation of gene expression. Modifications of histones are integral to these regulatory processes in concert with associated proteins, such as transcription factors and coactivators. One of the biochemical techniques available to enhance analysis of histone proteins is chemical derivatization using propionic anhydride. In this protocol, we describe the use of propionylation to efficiently derivatize acid-extracted histones from rice. We also synthesize H3 and H4 tryptic peptides, thus mimicking the nature of derivatized extracted peptides to aid in identification and quantification using targeted-mass spectrometry. Here we make available the masses of the precursor ions and the retention times (RT) of each synthesized peptide. These provide useful information to facilitate histone data analysis. Lastly, we note that we will distribute these synthetic peptides in nanomolar (nM) concentrations to those who wish to utilize them for assays and further experimental studies.