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プロテオーム分析の場合、組織サンプルは、主にスナップフローズンまたはホルマリン固定のパラフィン包埋形態のいずれかを保存します。RNALATER-の使用非毒性溶液の使用主に、ヒト組織のスナップフロゼンの保存と等しく信頼できるプロテオーム分析のための組織保存のサンプルのRNA含有量を安定化するために使用されました。RNALATERの貯蔵は、末梢血単核細胞（PBMC）の保存に大きな可能性がありますが、プロテオーム分析の結果への影響は、定性的および定量的測定ではあまり記述されていません。本研究では、3つの抽出バッファーを使用して、RNALATER保存および新鮮なPBMCのタンパク質プロファイルを調査しました。Triton X-100、RIPAおよびSDS。タンパク質はSDS-PAGEで分離され、濃度測定を使用して定量化されます。25〜250 kDaの範囲の分子量で、RNALATER貯蔵セルからの新鮮な帯域と15.6バンドの平均19.3帯域が得られました。RNALATER貯蔵は、低分子量タンパク質の数が少なくなり、同様または大量の高分子量タンパク質画分が生成されました。主成分分析では、Triton X-100がSDSおよびRIPAに比べてタンパク質バンドと生成量に関して劣っていることが示されました。RNALATERはプロテオーム分析のためにPBMCを保存するのに効果的ですが、特にターゲットが低分子量タンパク質である場合、プロテオミクス実験での使用には注意が必要です。
プロテオーム分析の場合、組織サンプルは、主にスナップフローズンまたはホルマリン固定のパラフィン包埋形態のいずれかを保存します。RNALATER-の使用非毒性溶液の使用主に、ヒト組織のスナップフロゼンの保存と等しく信頼できるプロテオーム分析のための組織保存のサンプルのRNA含有量を安定化するために使用されました。RNALATERの貯蔵は、末梢血単核細胞（PBMC）の保存に大きな可能性がありますが、プロテオーム分析の結果への影響は、定性的および定量的測定ではあまり記述されていません。本研究では、3つの抽出バッファーを使用して、RNALATER保存および新鮮なPBMCのタンパク質プロファイルを調査しました。Triton X-100、RIPAおよびSDS。タンパク質はSDS-PAGEで分離され、濃度測定を使用して定量化されます。25〜250 kDaの範囲の分子量で、RNALATER貯蔵セルからの新鮮な帯域と15.6バンドの平均19.3帯域が得られました。RNALATER貯蔵は、低分子量タンパク質の数が少なくなり、同様または大量の高分子量タンパク質画分が生成されました。主成分分析では、Triton X-100がSDSおよびRIPAに比べてタンパク質バンドと生成量に関して劣っていることが示されました。RNALATERはプロテオーム分析のためにPBMCを保存するのに効果的ですが、特にターゲットが低分子量タンパク質である場合、プロテオミクス実験での使用には注意が必要です。
For proteome analyses, the tissue samples are mostly preserved either snap frozen or formalin-fixed, paraffin-embedded form. Use of RNAlater-a non-toxic solution primarily used to stabilize the RNA content of samples-in tissue preservation for proteome analysis recently described equally reliable with snap-frozen preservation in human tissues. Even though RNALater storage has great potential in the preservation of Peripheral Blood Mononuclear Cells (PBMC), its impact on the results of proteome analysis is poorly described at qualitative and quantitative measures. The present study investigated protein profiles of RNAlater preserved and fresh PBMCs using three extraction buffers viz. Triton X-100, RIPA and SDS. Proteins are separated in SDS-PAGE and quantified using densitometry. On an average 19.3 bands from fresh and 15.6 bands from RNAlater storage cells were obtained with a molecular weight ranging from 25 to > 250 kDa. RNAlater storage generated a fewer number and lesser quantity of low molecular weight proteins while yielded a similar or high quantity of high molecular weight protein fractions. The principal component analysis showed that Triton X-100 is inferior as compared to SDS and RIPA with respect to their protein bands and quantity yielded. While RNAlater is effective in preserving PBMC for proteome analysis, our findings warrant caution in its use in proteomics experiments especially if the target is low molecular weight proteins.
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