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Scientific reports2020Mar04Vol.10issue(1)

マレーシア半島における絶滅危ed種のマラヤンタピル(Tapirus indicus)の人口性別の分子性別と予備評価

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文献タイプ:
  • Journal Article
  • Research Support, Non-U.S. Gov't
概要
Abstract

性決定領域Y(SRY)および亜鉛フィンガー(ZF)遺伝子の一部のポリメラーゼ連鎖反応(PCR)増幅による分子性別法、および6つの馬Y染色体特異的マイクロサテライトマーカーがテストされました。マラヤンタピル(Tapirus indicus)。マイクロサテライトマーカーは、性視野の男性固有のアンプリコンを生成しませんでしたが、SRY/ZFマーカーシステムは、全血、乾燥した血液スポット(DB)、または使用を使用して、正確にセックスタイピング31を参照することにより、信頼できる分子性別結果を生成しました。DNA抽出のための材料としての組織サンプル。マーカーシステムは16の糞便サンプルでもテストされ、結果は一般的に、いくつかの増幅障害にもかかわらず、動物の事前に決定された性別と一致していました。野生のマラヤンタピル人口の性比の予備的推定は、野生生物ゲノムリソースバンク(WGRB)野生生物および国立公園局(ペルヒリタン)、動物園、およびスンガイデュスン野生生物保護センター(WCC)のデータベースから推定されました。分子性別の結果から、性別の不明の12サンプル。性比全体は女性を支持していましたが、平等からの偏差は、少量のサンプルサイズによって引き起こされる統計的能力の低下が原因であるため、二項検査(p> 0.05)を使用してテストされた場合、統計的に有意ではありませんでした。

性決定領域Y(SRY)および亜鉛フィンガー(ZF)遺伝子の一部のポリメラーゼ連鎖反応(PCR)増幅による分子性別法、および6つの馬Y染色体特異的マイクロサテライトマーカーがテストされました。マラヤンタピル(Tapirus indicus)。マイクロサテライトマーカーは、性視野の男性固有のアンプリコンを生成しませんでしたが、SRY/ZFマーカーシステムは、全血、乾燥した血液スポット(DB)、または使用を使用して、正確にセックスタイピング31を参照することにより、信頼できる分子性別結果を生成しました。DNA抽出のための材料としての組織サンプル。マーカーシステムは16の糞便サンプルでもテストされ、結果は一般的に、いくつかの増幅障害にもかかわらず、動物の事前に決定された性別と一致していました。野生のマラヤンタピル人口の性比の予備的推定は、野生生物ゲノムリソースバンク(WGRB)野生生物および国立公園局(ペルヒリタン)、動物園、およびスンガイデュスン野生生物保護センター(WCC)のデータベースから推定されました。分子性別の結果から、性別の不明の12サンプル。性比全体は女性を支持していましたが、平等からの偏差は、少量のサンプルサイズによって引き起こされる統計的能力の低下が原因であるため、二項検査(p> 0.05)を使用してテストされた場合、統計的に有意ではありませんでした。

A molecular sexing method by polymerase chain reaction (PCR) amplification of a portion of the sex-determining region Y (SRY) and the zinc finger (ZF) gene, as well as six equine Y-chromosome-specific microsatellite markers, were tested in the Malayan tapir (Tapirus indicus). While the microsatellite markers did not yield any male-specific amplicons for sex-typing, the SRY/ZF marker system produced reliable molecular sexing results by accurately sex-typing 31 reference Malayan tapirs, using whole blood, dried blood spot (DBS), or tissue samples as materials for DNA extraction. The marker system was also tested on 16 faecal samples, and the results were in general consistent with the pre-determined sexes of the animals, despite some amplification failures. A preliminary estimation of wild Malayan tapir population sex ratio was estimated from the Wildlife Genomic Resource Bank (WGRB) database of the Malaysian Department of Wildlife and National Parks (PERHILITAN), zoos, and the Sungai Dusun Wildlife Conservation Centre (WCC), as well as from the results of molecular sexing 12 samples of unknown sex. The overall sex ratio favoured females, but the deviation from parity was statistically not significant when tested using the binomial test (p > 0.05), which may be due to reduced statistical power caused by small sample sizes.

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