前立腺癌の腫瘍内の不均一性と遺伝的特性

前立腺癌は不均一な疾患であり、治療を標的とする最適な遺伝子は許されないことがよくあります。前立腺がんの腫瘍内ゲノム不均一性を判断し、標的療法の候補遺伝子を探索することを目指しています。前立腺癌の16人の患者から37のサンプルでExomeシーケンスを実施しました。体細胞変異分析、コピー数バリアント（CNV）分析、クローン進化分析、およびバリアントスペクトル分析を使用して、転移性前立腺癌の腫瘍内ゲノム不均一性と遺伝的特性を研究しました。私たちの研究では、共有バリアントの数、腫瘍変異負荷（TMB）、バリアント遺伝子、CNV負担、加重ゲノム不安定性指数（WGII）、CNVプロファイル、クローン進化プロセスなど、多くの側面における前立腺がんの高い腫瘍内遺伝性不均一性が確認されました。スペクトルおよび変異シグネチャ。さらに、前立腺癌のいくつかの一般的な遺伝的特性を特定しました。DNA損傷修復遺伝子の変化、RTK/RAS経路関連遺伝子RASGRF1およびオートファジー遺伝子EPG5は、前立腺癌の腫瘍形成に関与している可能性があります。CNVの負担およびDNA損傷修復（DDR）遺伝子は、前立腺癌の転移に関連している可能性があります。

Prostate cancer is a heterogeneous disease and optimum gene targeting treatment is often impermissible. We aim to determine the intratumoral genomic heterogeneity of prostate cancer and explore candidate genes for targeted therapy. Exome sequencing was performed on 37 samples from 16 patients with prostate cancer. Somatic variant analysis, copy number variant (CNV) analysis, clonal evolution analysis and variant spectrum analysis were used to study the intratumoral genomic heterogeneity and genetic characteristics of metastatic prostate cancer. Our study confirmed the high intratumoral genetic heterogeneity of prostate cancer in many aspects, including number of shared variants, tumor mutation burden (TMB), variant genes, CNV burden, weighted genome instability index (wGII), CNV profiles, clonal evolutionary process, variant spectrum and mutational signatures. Moreover, we identified several common genetic characteristics of prostate cancer. Alterations of DNA damage repair genes, RTK/RAS pathway associated gene RASGRF1 and autophagy gene EPG5 may be involved in tumorigenesis in prostate cancer. CNV burden and DNA damage repair (DDR) genes may be associated with metastasis of prostate cancer.