太平洋カキ（Crassostrea gigas）の幼虫の死亡率を引き起こすビブリオcoralliilticusの識別とゲノム分析

Vibrio coralliiliticusは、世界中の海洋二枚貝にも感染するサンゴの病原体として知られています。死亡率を引き起こすため、人工海洋の二枚貝の種子生産の主要な制約の1つであると考えられています。この研究では、韓国の太平洋カキの幼虫死亡の原因であるSnuty-1として指定されたV. coralliiliticusの高い毒性を最初に分離し、特徴づけました。病原性テストでは、24時間2.14×105 cfu/mlに曝露すると、死亡率がテストされた健康な太平洋カキの幼虫の88.65±2.4％になりました。Snuty-1は、ペニシリン、セファロスポリン、カルバペネムなどのβ-ラクタムに対して抗菌耐性を示しました。Snuty-1（5,842,676 bp）の完全なゲノムを配列決定および組み立てました。これは、2つの染色体（CHR IおよびCHRI）と2つのプラスミド（PSNUTY1およびPSNUTY2）で構成されています。COG機能分析では、CHR IがCHRIと比較して基本的な細胞機能に関連する遺伝子が増えていることが確認されました。Orthoaniの値に基づいた系統樹の結果は、Snuty-1がV. coralliilicus株と密接に関連していることを示しました。Snuty-1にはユニークなプラスミド（psnuty2）がありました。これは、韓国の分離株が異なる地理的起源からの他のシーケンスV. coralliilicus株とは異なることを意味する可能性があります。サイトリシン/ヘモリシンや細胞外メタロプロテアーゼ遺伝子などの毒性タンパク質は、Snuty-1のChr IおよびChr IIにコード化されました。これらのデータは、この生物の生物多様性と病原性因子の研究のための貴重な情報について貴重な洞察を提供することにより、水産養殖におけるV. coralliiliticus感染の制御を促進します。

Vibrio coralliilyticus is known as a coral pathogen that also infects marine bivalve larvae worldwide. It is considered to be one of the major constraints in artificial marine bivalve seed production as it causes mortality. In this study, we first isolated and characterized a high virulent of V. coralliilyticus designated as SNUTY-1 that was the cause of Pacific oyster larvae mortality in Korea. In the pathogenicity test, exposure to 2.14 × 105 CFU/mL for 24 h caused mortality to 88.65 ± 2.4% of the tested healthy Pacific oyster larvae. SNUTY-1 showed anti-microbial resistance to β-lactams, such as penicillins, cephalosporins, and carbapenems. We sequenced and assembled the complete genome of SNUTY-1 (5,842,676 bp), consisting of two chromosomes (Chr I and Chr II) and two plasmids (pSNUTY1 and pSNUTY2). The COG functional analysis confirmed that Chr I had more genes associated with basic cellular functions in comparison to Chr II. The results of the phylogenetic trees based on OrthoANI values indicated that the SNUTY-1 was closely related to V. coralliilyticus strains. SNUTY-1 had a unique plasmid (pSNUTY2), which could mean that the Korean isolate is different from other sequenced V. coralliilyticus strains from different geographical origins. Toxic proteins such as cytolysin/hemolysin and extracellular metalloprotease genes were encoded on Chr I and Chr II of SNUTY-1. These data facilitate the control of V. coralliilyticus infections in aquaculture by providing valuable insights into the biodiversity of this organism and valuable information for the study of virulence factors.