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Journal of microbiology, immunology, and infection = Wei mian yu gan ran za zhi2020Dec01Vol.53issue(6)

バイオファイアフィルムアレイ血液培養識別パネルを使用して、血流の細菌および真菌病原体とその抗生物質耐性決定因子の積極的にフラグ付き血液培養からの迅速な同定

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文献タイプ:
  • Comparative Study
  • Journal Article
概要
Abstract

背景/目的:旗式血液培養から直接病原体とその抗生物質耐性の迅速かつ正確な同定は、臨床医が初期の抗生物質治療を最適化するのに役立ち、特にバンコマイシン耐性腸球菌によって引き起こされる血流感染率の高さに関連する環境において、臨床結果を改善することができます(vRE)およびカルバペネム耐性腸内細菌科(CRE)。Biofire Filmarray Blood Culture Identification(BCID)パネルの結果を、病原体とその抗生物質感受性状態を識別するための従来の方法の結果と比較しました。 方法:合計で、ランダムに選択された100個の陽性血液培養(Bactec Plus Aerobic/FボトルまたはBactec嫌気性溶解/10本)を分析しました。FilmArray BCIDパネルの病原体検出効率は、Maldi-TOF MSシステム(Bruker Maldi Biotyper)およびVitek 2システムによる感受性試験を使用した従来の方法の効率と比較されました。Maldi BiotyperおよびVitek 2から得られた矛盾した結果のために、抗生物質耐性遺伝子のシーケンス分析を実施しました。 結果:100の積極的にフラグが立てられた血液培養のうち、FilmArray BCIDパネルの結果の94%がMaldi Biotyperの結果と一致していました。VANA/VANB遺伝子に対して陽性の5つのVRE分離株すべて、MECA遺伝子に陽性の12個のブドウ球菌種のうち10種のうち10種の肺炎球菌分離株は、肺炎球カルバペネマゼ遺伝子(BLAKPC)に陽性である1人のみが、フィルムアレイBCIDパネルで検出された陽性であると分離しました。従来の感受性試験/分子確認による結果。 結論:FilmArray BCIDパネルの結果は、特にMRSA、VRE、およびBLAKPCを介したCREの早期検出のために、従来の血液培養の識別と感受性の結果と良好な相関関係を実証しただけでなく、迅速に結果をもたらしました。

背景/目的:旗式血液培養から直接病原体とその抗生物質耐性の迅速かつ正確な同定は、臨床医が初期の抗生物質治療を最適化するのに役立ち、特にバンコマイシン耐性腸球菌によって引き起こされる血流感染率の高さに関連する環境において、臨床結果を改善することができます(vRE)およびカルバペネム耐性腸内細菌科(CRE)。Biofire Filmarray Blood Culture Identification(BCID)パネルの結果を、病原体とその抗生物質感受性状態を識別するための従来の方法の結果と比較しました。 方法:合計で、ランダムに選択された100個の陽性血液培養(Bactec Plus Aerobic/FボトルまたはBactec嫌気性溶解/10本)を分析しました。FilmArray BCIDパネルの病原体検出効率は、Maldi-TOF MSシステム(Bruker Maldi Biotyper)およびVitek 2システムによる感受性試験を使用した従来の方法の効率と比較されました。Maldi BiotyperおよびVitek 2から得られた矛盾した結果のために、抗生物質耐性遺伝子のシーケンス分析を実施しました。 結果:100の積極的にフラグが立てられた血液培養のうち、FilmArray BCIDパネルの結果の94%がMaldi Biotyperの結果と一致していました。VANA/VANB遺伝子に対して陽性の5つのVRE分離株すべて、MECA遺伝子に陽性の12個のブドウ球菌種のうち10種のうち10種の肺炎球菌分離株は、肺炎球カルバペネマゼ遺伝子(BLAKPC)に陽性である1人のみが、フィルムアレイBCIDパネルで検出された陽性であると分離しました。従来の感受性試験/分子確認による結果。 結論:FilmArray BCIDパネルの結果は、特にMRSA、VRE、およびBLAKPCを介したCREの早期検出のために、従来の血液培養の識別と感受性の結果と良好な相関関係を実証しただけでなく、迅速に結果をもたらしました。

BACKGROUND/PURPOSE: Rapid and accurate identification of pathogens and their antibiotic resistance directly from flagged blood cultures can aid clinicians in optimizing early antibiotic treatment and improve the clinical outcomes, especially in settings associated with high rates of bloodstream infection caused by vancomycin-resistant Enterococci (VRE) and carbapenem-resistant Enterobacteriaceae (CRE). We compared the results of the BioFire FilmArray Blood Culture Identification (BCID) panel with those of conventional methods for identifying the pathogens and their antibiotic susceptibility status. METHODS: In total, 100 randomly selected positive blood cultures (BACTEC Plus Aerobic/F bottles or BACTEC Anaerobic Lytic/10 bottles) were analyzed. The pathogen detection efficiency of FilmArray BCID panel was compared with that of conventional method using MALDI-TOF MS system (Bruker MALDI Biotyper) and susceptibility testing by the Vitek 2 system. The sequencing analysis of antibiotic resistance genes was performed for discrepant results obtained from MALDI Biotyper and Vitek 2. RESULTS: Among the 100 positively flagged blood cultures, 94% of FilmArray BCID panel results were consistent with the MALDI Biotyper results. All five VRE isolates positive for vanA/vanB genes, 10 of 12 Staphylococcus species positive for mecA gene, and only one Klebsiella pneumoniae isolate positive for K. pneumoniae carbapenemase gene (blaKPC) detected in the FilmArray BCID panel were also concordant with results by the results by conventional susceptibility testing/molecular confirmation. CONCLUSIONS: The FilmArray BCID panel results not only demonstrated good correlation with conventional blood culture identification and susceptibility results but also provided results rapidly, especially for the early detection of MRSA, VRE and blaKPC-mediated CRE.

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