DNAエンコードライブラリの概要：創薬のための汎用性の高いツール

DNA エンコード ライブラリ (DEL) は、各ライブラリ メンバーの構造に関する固有の情報を保持する、増幅可能な DNA タグに共有結合した小分子のコレクションです。コンビナトリアルアプローチを使用して、反復的な DNA コード化ステップでライブラリを構築し、DNA シークエンシングによる結合化合物の合成履歴の追跡を容易にします。最大数十億の異なる小分子を含むプールからタンパク質標的結合剤を選択できるようにするさまざまなスクリーニングプロトコルが開発されています。汎用性の高い方法論により、多数の生物学的に活性な化合物の同定が可能になり、現在、有力な発見キャンペーンや化学プローブの同定のためのツールとして採用されることが増えています。近年、DEL の小分子ライブラリーメンバーの構造多様性を拡張する DNA 適合性化学の開発に大きな焦点が当てられています。この章では、DEL テクノロジーの課題と成果の概要を示し、機会、限界、将来の方向性の観点から DEL の作成とスクリーニングの技術的側面をレビューします。

DNA-encoded libraries (DELs) are collections of small molecules covalently attached to amplifiable DNA tags carrying unique information about the structure of each library member. A combinatorial approach is used to construct the libraries with iterative DNA encoding steps, facilitating tracking of the synthetic history of the attached compounds by DNA sequencing. Various screening protocols have been developed which allow protein target binders to be selected out of pools containing up to billions of different small molecules. The versatile methodology has allowed identification of numerous biologically active compounds and is now increasingly being adopted as a tool for lead discovery campaigns and identification of chemical probes. A great focus in recent years has been on developing DNA compatible chemistries that expand the structural diversity of the small molecule library members in DELs. This chapter provides an overview of the challenges and accomplishments in DEL technology, reviewing the technological aspects of producing and screening DELs with a perspective on opportunities, limitations, and future directions.