季節性の生息地は、脱骨北極チャー（Salvelinus alpinus）の腸内微生物組成を駆動します

カナダのヌナブトにある高北極キチクメト地域の362のアナドロム北極チャー（Salvelinus alpinus）の腸内微生物群集は、ハイスループット16S rRNA遺伝子シーケンスを使用して特徴付けられました。得られた細菌群集は、年間移動の異なる段階に対応する4つの季節の生息地で比較されました。北極の腸のコミュニティは、サンプリングサイト、塩分、淡水住居の段階によって異なりました。汽水でサンプリングされた魚からの微生物叢は、他の無脱型サケ科で見られる分類群と非常に一致していたが、それらは、これらの水からの腸のサンプルの90％を超えて検出された非発光性腸共生生物門窩イリオピスカリウムを含む推定的な精神薬で濃縮された。淡水関連の魚の微生物叢は、他のサケ科植物について報告された結果とはあまり一致しておらず、これらのチャーの冬の断食挙動を反映している可能性があります。秋の上流の移動中にサンプリングされた魚の年齢への微生物叢リンクを特定しましたが、腸内群集に対する腸の含有量と水微生物叢の影響はほとんどありませんでした。腸内群集の構成の最強のドライバーは季節的な生息地であり、この発見は、高精神薬物の特定と組み合わされたことで、水温と渡り行動が北極のcharとその共生生物の関係を理解するための鍵であることを示唆しました。

Intestinal microbial communities from 362 anadromous Arctic char (Salvelinus alpinus) from the high Arctic Kitikmeot region, Nunavut, Canada, were characterized using high-throughput 16S rRNA gene sequencing. The resulting bacterial communities were compared across four seasonal habitats that correspond to different stages of annual migration. Arctic char intestinal communities differed by sampling site, salinity and stages of freshwater residence. Although microbiota from fish sampled in brackish water were broadly consistent with taxa seen in other anadromous salmonids, they were enriched with putative psychrophiles, including the nonluminous gut symbiont Photobacterium iliopiscarium that was detected in >90% of intestinal samples from these waters. Microbiota from freshwater-associated fish were less consistent with results reported for other salmonids, and highly variable, possibly reflecting winter fasting behaviour of these char. We identified microbiota links to age for those fish sampled during the autumn upriver migration, but little impact of the intestinal content and water microbiota on the intestinal community. The strongest driver of intestinal community composition was seasonal habitat, and this finding combined with identification of psychrophiles suggested that water temperature and migratory behaviour are key to understanding the relationship between Arctic char and their symbionts.