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XV Banff Conferenceのこの会議レポートでは、Banff Molecular Diagnostics Working Group（MDWG）によるマルチオルガン移植遺伝子パネルの作成について説明しています。このバンフヒト臓器移植（B-HOT）パネルは、MDWGによる以前の研究の頂点であり、全体的なトランスクリプトーム技術に基づいて広く有用な遺伝子パネルを特定しています。データ駆動型プロセスは、腎臓、肝臓、心臓、肺移植生検での使用を発見および検証した査読付き包括的なマイクロアレイ研究から遺伝子リストを蒸留しました。これらは、関連する細胞経路と細胞型と正規化に使用される12の参照遺伝子を定義する遺伝子によって補完されました。770遺伝子B-HOTパネルには、拒絶、耐性、ウイルス感染、および自然および適応免疫応答に関連する最も適切な遺伝子が含まれています。この市販のパネルは、ナノストリングプラットフォームを使用しており、ホルマリン固定パラフィン包埋サンプルからの転写産物を定量化できます。B-HOTパネルは、アーカイブサンプルを使用した多施設共同臨床研究を促進し、標準化された分析のオープンソースの大規模データベースの開発を可能にし、それにより臨床検証研究を促進します。MDWGは、病因と経路ベースの分子アプローチが研究者にとって価値があり、治療上の意思決定と臨床試験を促進すると考えています。
XV Banff Conferenceのこの会議レポートでは、Banff Molecular Diagnostics Working Group（MDWG）によるマルチオルガン移植遺伝子パネルの作成について説明しています。このバンフヒト臓器移植（B-HOT）パネルは、MDWGによる以前の研究の頂点であり、全体的なトランスクリプトーム技術に基づいて広く有用な遺伝子パネルを特定しています。データ駆動型プロセスは、腎臓、肝臓、心臓、肺移植生検での使用を発見および検証した査読付き包括的なマイクロアレイ研究から遺伝子リストを蒸留しました。これらは、関連する細胞経路と細胞型と正規化に使用される12の参照遺伝子を定義する遺伝子によって補完されました。770遺伝子B-HOTパネルには、拒絶、耐性、ウイルス感染、および自然および適応免疫応答に関連する最も適切な遺伝子が含まれています。この市販のパネルは、ナノストリングプラットフォームを使用しており、ホルマリン固定パラフィン包埋サンプルからの転写産物を定量化できます。B-HOTパネルは、アーカイブサンプルを使用した多施設共同臨床研究を促進し、標準化された分析のオープンソースの大規模データベースの開発を可能にし、それにより臨床検証研究を促進します。MDWGは、病因と経路ベースの分子アプローチが研究者にとって価値があり、治療上の意思決定と臨床試験を促進すると考えています。
This meeting report from the XV Banff conference describes the creation of a multiorgan transplant gene panel by the Banff Molecular Diagnostics Working Group (MDWG). This Banff Human Organ Transplant (B-HOT) panel is the culmination of previous work by the MDWG to identify a broadly useful gene panel based on whole transcriptome technology. A data-driven process distilled a gene list from peer-reviewed comprehensive microarray studies that discovered and validated their use in kidney, liver, heart, and lung transplant biopsies. These were supplemented by genes that define relevant cellular pathways and cell types plus 12 reference genes used for normalization. The 770 gene B-HOT panel includes the most pertinent genes related to rejection, tolerance, viral infections, and innate and adaptive immune responses. This commercially available panel uses the NanoString platform, which can quantitate transcripts from formalin-fixed paraffin-embedded samples. The B-HOT panel will facilitate multicenter collaborative clinical research using archival samples and permit the development of an open source large database of standardized analyses, thereby expediting clinical validation studies. The MDWG believes that a pathogenesis and pathway based molecular approach will be valuable for investigators and promote therapeutic decision-making and clinical trials.
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