血液液生検の解釈におけるクローン造血の臨床的意義

血漿無細胞DNA（CFDNA）の次世代シーケンス（NGS）の使用は臨床環境で拡大し続けるため、循環腫瘍DNA変異の正確な同定は、がん患者の臨床管理におけるその使用を検証するために重要です。ここでは、同じウルトロディープNGSアッセイを使用して、血漿CfDNAおよび腫瘍組織のクローン造血（CH）関連の変異を含む変異を特徴付けることを目指し、液体生物術結果の解釈におけるCH関連変異の臨床的意義を評価することを目指しました。腫瘍汎キャンサーパネルを使用したウルトレイディップ標的NGSは、38人の結腸直腸癌患者からの一致した外科的切除腫瘍組織、末梢血細胞（PBC）、および120の血漿CFDNAサンプルで実施されました。血漿CfDNAにおけるCH関連変異の臨床的意義は、術後血漿サンプルの縦方向のモニタリングによって評価されました。38人の患者のうち、腫瘍組織から74の非同義突然変異が特定され、術前血漿サンプルから64の変異が確認されました。血漿CfDNAで同定された64の変異の11（17％）もPBC DNAで検出され、CH関連の変異であることが同定されました。全体として、このコホートの38人のうち11人（29％）の患者は、血漿CfDNAに少なくとも1人のCH関連の突然変異を抱いていました。これらのCH関連の変異は、残存疾患の存在または治療反応の欠如として誤解される可能性のある3人の患者からの術後血漿サンプルで継続的に検出されました。我々の結果は、PBCの変異情報を統合して、液体生検分析におけるCH関連の変異から誘導された腫瘍を区別することが不可欠であることを示しています。これにより、癌患者の誤った情報の臨床管理を避けるために、結果の誤解が妨げられます。

As the use of next-generation sequencing (NGS) for plasma cell-free DNA (cfDNA) continues to expand in clinical settings, accurate identification of circulating tumor DNA mutations is important to validate its use in the clinical management for cancer patients. Here, we aimed to characterize mutations including clonal hematopoiesis (CH)-related mutations in plasma cfDNA and tumor tissues using the same ultradeep NGS assay and evaluate the clinical significance of CH-related mutations on the interpretation of liquid biopsy results. Ultradeep targeted NGS using Oncomine Pan-Cancer Panel was performed on matched surgically resected tumor tissues, peripheral blood cells (PBCs), and 120 plasma cfDNA samples from 38 colorectal cancer patients. The clinical significance of the CH-related mutations in plasma cfDNA was evaluated by longitudinal monitoring of the postoperative plasma samples. Among the 38 patients, 74 nonsynonymous mutations were identified from tumor tissues and 64 mutations from the preoperative plasma samples. Eleven (17%) of the 64 mutations identified in plasma cfDNA were also detected in PBC DNA and were identified to be CH-related mutations. Overall, 11 of 38 (29%) patients in this cohort harbored at least one CH-related mutation in plasma cfDNA. These CH-related mutations were continuously detected in subsequent postoperative plasma samples from three patients which could be misinterpreted as the presence of residual disease or as lack of treatment response. Our results indicated that it is essential to integrate the mutational information of PBCs to differentiate tumor-derived from CH-related mutations in liquid biopsy analysis. This would prevent the misinterpretation of results to avoid misinformed clinical management for cancer patients.