ヌクレオカプシドホスホタンパク質のRNA結合ドメインとのクロロキンおよびヒドロキシクロロキン相互作用のドッキング研究 - 再利用抗ウイルス薬の比較有効性に関するインシリコの洞察

世界中の新規コロナウイルス疾患（）パンデミックの最近の発生は、重度の急性呼吸器症候群に関連しています。パンデミックに関連する死者数は日々増加しています。SARS-COV-2は包まれたウイルスであり、ヌクレオカプシドタンパク質（Nタンパク質）のN末端ドメイン（NTD）はウイルス（+）Sense RNAに結合し、ウイルスリボヌクレオプロティアン複合体をウイルス複製に不可欠にします。Nタンパク質は、NTDとC末端（CTD）の間に挟まれたセリンリッチリンカー領域で構成されています。これらの端子は、ウイルスエントリとその処理後のエントリに役割を果たします。SARS-COV-2 Nタンパク質のNTDは、矯正結晶を形成し、ウイルスゲノムに結合します。したがって、ヌクレオカプシドホスホタンパク質（NTD-Nタンパク質のRNA結合ドメイン（NTD-Nタンパク質）の標的となる標的ドメインが常に標的とするための探求があります。これは、ヒトのSARS-COV-2によって引き起こされる疾患の制御に役立ちます。この研究に関連するいくつかの副作用のために、依然として、SARS-COV-2のNTD-Nタンパク質とのシリコ相互作用が含まれます。私たちの研究において、両方の薬物の有効性をNTD-Nタンパク質に結合することにより、患者の治療のためのこれらの両方の抗ウイルス薬の潜在的な役割は、結合エネルギーを伴うNTD-N-タンパク質の潜在的な阻害効果を示しました。感受性細胞のSARS-COV-2受容体認識でのクロロキン（-6.30 kcal/mol）よりもkcal/mol。さらに、推奨されるヒドロキシクロロキンの用量は、診断されていない限り、コロナウイルス患者と接触したり、コロナウイルス患者に直接ケアを提供している医療従事者やスタッフに捕まえる可能性を減らす可能性があります。さらに、適切なワクチンの発見まで、他の候補者の再利用薬の比較有効性を理解するのに役立つ可能性があると考えています。

Recent outbreak of novel Coronavirus disease () pandemic around the world is associated with severe acute respiratory syndrome. The death toll associated with the pandemic is increasing day by day. SARS-CoV-2 is an enveloped virus and its N terminal domain (NTD) of Nucleocapsid protein (N protein) binds to the viral (+) sense RNA and results in virus ribonucleoprotien complex, essential for the virus replication. The N protein is composed of a serine-rich linker region sandwiched between NTD and C terminal (CTD). These terminals play a role in viral entry and its processing post entry. The NTD of SARS-CoV-2 N protein forms orthorhombic crystals and binds to the viral genome. Therefore, there is always a quest to target RNA binding domain of nucleocapsid phosphoprotein (NTD-N-protein which in turn may help in controlling diseases caused by SARS-CoV-2 in humans. The role of Chloroquine and Hydroxychloroquine as potential treatments for is still under debate globally because of some side effects associated with it. This study involves the In silico interactions of Chloroquine and Hydroxychloroquine with the NTD-N-protein of SARS-CoV-2. With the help of various computational methods, we have explored the potential role of both of these antiviral drugs for the treatment of patients by comparing the efficacy of both of the drugs to bind to NTD-N-protein. In our research Hydroxychloroquine exhibited potential inhibitory effects of NTD-N-protein with binding energy -7.28 kcal/mol than Chloroquine (-6.30 kcal/mol) at SARS-CoV-2 receptor recognition of susceptible cells. The outcomes of this research strongly appeal for in vivo trials of Hydroxychloroquine for the patients infected with . Furthermore, the recommended doses of Hydroxychloroquine may reduce the chances of catching to the healthcare workers and staff who are in contact with or delivering direct care to coronavirus patients as long as they have not been diagnosed with . We further hypothesize that the comparative NTD-N-protein -drug docking interactions may help to understand the comparative efficacy of other candidate repurposing drugs until discovery of a proper vaccine.Communicated by Ramaswamy H. Sarma.