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急速な化学毒性の評価と機械的仮説生成をサポートするために、ここでは、ユーザーが物質が効果を生成する可能性が高いと推定される人体のターゲット臓器を特定できるように、直感的なWebtoolを提示します。Tox21BodyMAPと呼ばれるこのツールには、臓器固有の遺伝子発現データを使用してターゲットがヒト臓器にマッピングされた971ハイスループットスクリーニング(HTS)アッセイで米国連邦TOX21研究コンソーシアムでテストされた9,270の化学物質の結果が組み込まれています。Tox21BodyMAPのインタラクティブツールを介して、ユーザーは臓器システムごとに化学ターゲットの特異性を視覚化し、遺伝子発現のしきい値と活動濃度パラメーターを変更することにより、異なるフィルタリング基準を実装できます。すべてのTOX21 HTSアッセイターゲットにわたって包括的なアクティビティサマリを備えた動的ネットワーク表現、データテーブル、およびプロットは、化学生物活性の全体像を提供します。tox21bodymap webserverはhttps://sandbox.ntp.niehs.nih.gov/bodymap/で入手できます。
急速な化学毒性の評価と機械的仮説生成をサポートするために、ここでは、ユーザーが物質が効果を生成する可能性が高いと推定される人体のターゲット臓器を特定できるように、直感的なWebtoolを提示します。Tox21BodyMAPと呼ばれるこのツールには、臓器固有の遺伝子発現データを使用してターゲットがヒト臓器にマッピングされた971ハイスループットスクリーニング(HTS)アッセイで米国連邦TOX21研究コンソーシアムでテストされた9,270の化学物質の結果が組み込まれています。Tox21BodyMAPのインタラクティブツールを介して、ユーザーは臓器システムごとに化学ターゲットの特異性を視覚化し、遺伝子発現のしきい値と活動濃度パラメーターを変更することにより、異なるフィルタリング基準を実装できます。すべてのTOX21 HTSアッセイターゲットにわたって包括的なアクティビティサマリを備えた動的ネットワーク表現、データテーブル、およびプロットは、化学生物活性の全体像を提供します。tox21bodymap webserverはhttps://sandbox.ntp.niehs.nih.gov/bodymap/で入手できます。
To support rapid chemical toxicity assessment and mechanistic hypothesis generation, here we present an intuitive webtool allowing a user to identify target organs in the human body where a substance is estimated to be more likely to produce effects. This tool, called Tox21BodyMap, incorporates results of 9,270 chemicals tested in the United States federal Tox21 research consortium in 971 high-throughput screening (HTS) assays whose targets were mapped onto human organs using organ-specific gene expression data. Via Tox21BodyMap's interactive tools, users can visualize chemical target specificity by organ system, and implement different filtering criteria by changing gene expression thresholds and activity concentration parameters. Dynamic network representations, data tables, and plots with comprehensive activity summaries across all Tox21 HTS assay targets provide an overall picture of chemical bioactivity. Tox21BodyMap webserver is available at https://sandbox.ntp.niehs.nih.gov/bodymap/.
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