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Journal of clinical microbiology2020Aug24Vol.58issue(9)

新しく命名されたKlebsiella aerogenes(以前のEnterobacter aerogenes)は、血流感染症患者の他のエンテロバクター種と比較して臨床転帰不良に関連しています

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文献タイプ:
  • Journal Article
  • Research Support, N.I.H., Extramural
概要
Abstract

Enterobacter aerogenesは最近、K. aerogenes対Entenobacter種の血流感染症(BSI)の患者の臨床的特徴、結果、および細菌遺伝学の違いを特定することを目的としたKlebsiella aerogenesと改名されました。2002年から2015年まで、K。aerogenesまたはEnterobacter Cloacae Complex(ECC)BSIの患者を前向きに登録しました。すべてのバクテリアで全ゲノムシーケンス(WGS)とパンゲノム分析を実施しました。全体として、K。aerogenes(46/150 [31%])またはECC(104/150 [69%])BSIの患者150人が登録されました。2つのグループには、同様のベースライン特性がありました。院内死亡率(13/46 [28%]対22/104 [21%]; p = 0.3)も、院内死亡率(9/46 [20%]対13/104 [12%]もありません。p = 0.3)それぞれK. aerogenesとECC BSIの患者間で異なりました。しかし、臨床転帰不良(退院前の死亡、再発BSI、および/またはBSI合併症)は、K。aerogenesの方がECC BSI(32/46 [70%]対42/104 [40%]; P = 0.001)よりも高かった。多変量回帰モデルでは、ECC BSIと比較してK. aerogenes BSIは、臨床転帰不良を予測していました(オッズ比3.3; 95%信頼区間1.4〜8.1; P = 0.008)。パンゲノム分析により、鉄の獲得(n = 67)、フィンブリア/ピリ/鞭毛産生(n = 117)、および金属恒常性(n = = n =34)。抗生物質耐性は、他のすべての細菌分離株(23/96 [24%]; P = 0.03)と比較して、多剤耐性表現型(23/54 [43%])の割合が高いECC系統1で大部分が見られました。K. Aerogenes BSIは、ECC BSIと比較して臨床結果が低いことと関連していました。K. aerogenesの推定毒性因子は、これらの違いを説明するかもしれません。

Enterobacter aerogenesは最近、K. aerogenes対Entenobacter種の血流感染症(BSI)の患者の臨床的特徴、結果、および細菌遺伝学の違いを特定することを目的としたKlebsiella aerogenesと改名されました。2002年から2015年まで、K。aerogenesまたはEnterobacter Cloacae Complex(ECC)BSIの患者を前向きに登録しました。すべてのバクテリアで全ゲノムシーケンス(WGS)とパンゲノム分析を実施しました。全体として、K。aerogenes(46/150 [31%])またはECC(104/150 [69%])BSIの患者150人が登録されました。2つのグループには、同様のベースライン特性がありました。院内死亡率(13/46 [28%]対22/104 [21%]; p = 0.3)も、院内死亡率(9/46 [20%]対13/104 [12%]もありません。p = 0.3)それぞれK. aerogenesとECC BSIの患者間で異なりました。しかし、臨床転帰不良(退院前の死亡、再発BSI、および/またはBSI合併症)は、K。aerogenesの方がECC BSI(32/46 [70%]対42/104 [40%]; P = 0.001)よりも高かった。多変量回帰モデルでは、ECC BSIと比較してK. aerogenes BSIは、臨床転帰不良を予測していました(オッズ比3.3; 95%信頼区間1.4〜8.1; P = 0.008)。パンゲノム分析により、鉄の獲得(n = 67)、フィンブリア/ピリ/鞭毛産生(n = 117)、および金属恒常性(n = = n =34)。抗生物質耐性は、他のすべての細菌分離株(23/96 [24%]; P = 0.03)と比較して、多剤耐性表現型(23/54 [43%])の割合が高いECC系統1で大部分が見られました。K. Aerogenes BSIは、ECC BSIと比較して臨床結果が低いことと関連していました。K. aerogenesの推定毒性因子は、これらの違いを説明するかもしれません。

Enterobacter aerogenes was recently renamed Klebsiella aerogenes This study aimed to identify differences in clinical characteristics, outcomes, and bacterial genetics among patients with K. aerogenes versus Enterobacter species bloodstream infections (BSI). We prospectively enrolled patients with K. aerogenes or Enterobacter cloacae complex (Ecc) BSI from 2002 to 2015. We performed whole-genome sequencing (WGS) and pan-genome analysis on all bacteria. Overall, 150 patients with K. aerogenes (46/150 [31%]) or Ecc (104/150 [69%]) BSI were enrolled. The two groups had similar baseline characteristics. Neither total in-hospital mortality (13/46 [28%] versus 22/104 [21%]; P = 0.3) nor attributable in-hospital mortality (9/46 [20%] versus 13/104 [12%]; P = 0.3) differed between patients with K. aerogenes versus Ecc BSI, respectively. However, poor clinical outcome (death before discharge, recurrent BSI, and/or BSI complication) was higher for K. aerogenes than Ecc BSI (32/46 [70%] versus 42/104 [40%]; P = 0.001). In a multivariable regression model, K. aerogenes BSI, relative to Ecc BSI, was predictive of poor clinical outcome (odds ratio 3.3; 95% confidence interval 1.4 to 8.1; P = 0.008). Pan-genome analysis revealed 983 genes in 323 genomic islands unique to K. aerogenes isolates, including putative virulence genes involved in iron acquisition (n = 67), fimbriae/pili/flagella production (n = 117), and metal homeostasis (n = 34). Antibiotic resistance was largely found in Ecc lineage 1, which had a higher rate of multidrug resistant phenotype (23/54 [43%]) relative to all other bacterial isolates (23/96 [24%]; P = 0.03). K. aerogenes BSI was associated with poor clinical outcomes relative to Ecc BSI. Putative virulence factors in K. aerogenes may account for these differences.

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