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Current microbiology2020Sep01Vol.77issue(9)

メチロバクテリアsymbioticum sp nov、glomus var var tenuihypharumの胞子から分離された新しい種

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文献タイプ:
  • Journal Article
概要
Abstract

筋肉菌根菌の胞子から分離されたSB0023/3 t株Glomus var。tenuihypharumを分析して、それが新しい種を表すかどうかを判断しました。窒素肥料の入力を減らすために、農業の分野での適用性について研究されました。16S rRNA遺伝子配列の比較分析は、メチロバクテリウム属(98.7%)がメチロバクテリウムダンクックンと共有されるメチロバクテリウム属に所属するひずみを示しています。最新の細菌コア遺伝子(UBCG)を介したさらなる系統発生分析により、メチロバクテリウムダンクーケンスが最も近い相対として確認されました。平均ヌクレオチド同一性(ANI)およびインシリコDNA-DNAハイブリダイゼーション(DDH)は、系統発生系の親sが示す値のそれぞれ92%と44%未満でした。そのゲノムのおおよその長さは6.05 MBで、ゲノムのG+C含有量は70.1 mol%でした。主な細胞脂肪酸は、特徴8(C18:1Ω7Cおよび/またはC18:1Ω6C)を合計しました。それはグラム染色陰性、ピンクの飼育、厳密に好気性、および能力的なメチロ栄養栄養生物です。28ºCで成長し、塩化ナトリウムの存在下で最大3%の塩分で成長します。収集されたすべてのデータは、SB0023/3 T株に対応するための新規種の命名をサポートしています。11月。提案されています。型ひずみはSB0023/3 T(= CECT 9862 T = PYCC 8351 T)です。

筋肉菌根菌の胞子から分離されたSB0023/3 t株Glomus var。tenuihypharumを分析して、それが新しい種を表すかどうかを判断しました。窒素肥料の入力を減らすために、農業の分野での適用性について研究されました。16S rRNA遺伝子配列の比較分析は、メチロバクテリウム属(98.7%)がメチロバクテリウムダンクックンと共有されるメチロバクテリウム属に所属するひずみを示しています。最新の細菌コア遺伝子(UBCG)を介したさらなる系統発生分析により、メチロバクテリウムダンクーケンスが最も近い相対として確認されました。平均ヌクレオチド同一性(ANI)およびインシリコDNA-DNAハイブリダイゼーション(DDH)は、系統発生系の親sが示す値のそれぞれ92%と44%未満でした。そのゲノムのおおよその長さは6.05 MBで、ゲノムのG+C含有量は70.1 mol%でした。主な細胞脂肪酸は、特徴8(C18:1Ω7Cおよび/またはC18:1Ω6C)を合計しました。それはグラム染色陰性、ピンクの飼育、厳密に好気性、および能力的なメチロ栄養栄養生物です。28ºCで成長し、塩化ナトリウムの存在下で最大3%の塩分で成長します。収集されたすべてのデータは、SB0023/3 T株に対応するための新規種の命名をサポートしています。11月。提案されています。型ひずみはSB0023/3 T(= CECT 9862 T = PYCC 8351 T)です。

Strain SB0023/3 T, isolated from spores of the arbuscular mycorrhizal fungus Glomus iranicum var. tenuihypharum, was analysed to determine whether it represents a new species. It was studied for its applicability in the field of agriculture to reduce the input of nitrogen fertilizers. Comparative analysis of the 16S rRNA gene sequence shows the strain to be affiliated to the genus Methylobacterium, the closest similarities (98.7%) being shared with Methylobacterium dankookense. Further phylogenomic analysis through Up-to-date Bacterial Core Gene (UBCG) confirmed Methylobacterium dankookense as its closest relative. Average Nucleotide Identity (ANI) and in silico DNA-DNA hybridization (DDH) were lower than 92% and 44%, respectively, of the values shown by its phylogenetic relatives. Its genome had an approximate length of 6.05 Mb and the G + C content of the genome was 70.1 mol%. The main cellular fatty acid was Summed Feature 8 (C18:1ω7c and/or C18:1ω6c). It is a Gram-staining-negative, pink-pigmented, strictly aerobic and facultative methylotroph; it grows at 28 ºC and can grow at up to 3% salinity in the presence of sodium chloride. All the data collected support the naming of a novel species to accommodate the strain SB0023/3 T, for which the name Methylobacterium symbioticum sp. nov. is proposed. The type strain is SB0023/3 T (=CECT 9862 T =PYCC 8351 T).

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