米国の農業人口における成人の喘息とアトピーに関連する家の粉塵微生物叢

背景：家のほこりからの細菌曝露は、子供の喘息とアトピーに関連していますが、成人にこれらの関係が存在するかどうかは不明のままです。 目的：私たちは、家の粉塵微生物叢と成体喘息、アトピー、干し草の関連性を調べようとしました。 方法：農業コホート内に巣を作った喘息の症例対照研究である農業肺健康研究では、879人の参加者（平均年齢、62歳）の家からの掃除機dustサンプルが、16S rRNAアンプリコンシーケンスを受けて、細菌のコミュニティを特徴付けました。。アンケートと現在のアトピーを使用して現在の喘息と干し草の発熱を定義しました。線形回帰を使用して、サンプル内の細菌の多様性が結果、マイクロバイオームの回帰ベースのカーネル関連テストによって異なるかどうかを調べて、サンプル間の細菌群集の組成が結果と微生物叢の組成の分析が異なるかどうかを評価して、差別的に豊富な細菌の分類群を特定しました。 結果：家のほこりにおける細菌群集の全体的な多様性は、喘息の状態で類似していたが、アトピーまたは干し草の発熱により低かった（p <.05）。多くの個々の細菌分類群は、喘息、アトピー、または干し草の発熱により、差別的に豊富でした（誤検索率、<0.05）。シアノバクテリア、バクテロイド、およびフソバクテリアからのいくつかの分類群は、喘息、アトピー、または干し草の発熱により豊富でした。対照的に、しっかりした喘息のある個人（VS不十分に制御された喘息）、アトピーのない個人、または干し草のない個人の家の中で、硬化剤からのいくつかの分類群はより豊富でした。 結論：家の塵の微生物組成は、成人のアレルギーの結果に影響を与える可能性があります。

BACKGROUND: Bacterial exposure from house dust has been associated with asthma and atopy in children but whether these relationships are present in adults remains unclear. OBJECTIVE: We sought to examine associations of house dust microbiota with adult asthma, atopy, and hay fever. METHODS: Vacuumed bedroom dust samples from the homes of 879 participants (average age, 62 years) in the Agricultural Lung Health Study, a case-control study of asthma nested within a farming cohort, were subjected to 16S rRNA amplicon sequencing to characterize bacterial communities. We defined current asthma and hay fever using questionnaires and current atopy by blood specific IgE level > 0.70 IU/mL to 1 or more of 10 common allergens. We used linear regression to examine whether overall within-sample bacterial diversity differed by outcome, microbiome regression-based kernel association test to evaluate whether between-sample bacterial community compositions differed by outcome, and analysis of composition of microbiomes to identify differentially abundant bacterial taxa. RESULTS: Overall diversity of bacterial communities in house dust was similar by asthma status but was lower (P < .05) with atopy or hay fever. Many individual bacterial taxa were differentially abundant (false-discovery rate, <0.05) by asthma, atopy, or hay fever. Several taxa from Cyanobacteria, Bacteroidetes, and Fusobacteria were more abundant with asthma, atopy, or hay fever. In contrast, several taxa from Firmicutes were more abundant in homes of individuals with adequately controlled asthma (vs inadequately controlled asthma), individuals without atopy, or individuals without hay fever. CONCLUSIONS: Microbial composition of house dust may influence allergic outcomes in adults.