D-RETRO INVERSO AMYLINとアミリンフィブリルの安定性

Amylin凝集体が型II糖尿病で果たす役割に動機付けられ、通常のアミリンフィブリルの安定性を、L-アミノ酸鎖がD-Retro Inverso（DRI）アミリンに置き換えられるフィブリルの安定性と比較します。アミノ酸の配列は逆転し、同時に、L-アミノ酸は鏡像に置き換えられます。私たちの分子動力学シミュレーションは、フィブリル構造と安定性にわずかな違いのみにつながるにもかかわらず、ドリ - アミリンペプチドの凝集は、接触と水素結合の異なるパターンを持っていることを示しています。これらの違いのため、ドリ - アミリンは、通常の（L）アミリンと相互作用するときに、伸長プロセスを変化させ、ハイブリッドアミリンフィブリルの安定性を低下させます。我々の結果は、アミリンフィブリル形成の阻害剤としてのドリ - アミリンの潜在的な使用を示唆するだけでなく、特定の種類の水素結合の役割を調べる方法として、LアセンブリにDRIタンパク質を挿入する可能性を示しています。超分子アセンブリまたは集合体。

Motivated by the role that amylin aggregates play in type-II diabetes, we compare the stability of regular amylin fibrils with the stability of fibrils where l-amino acid chains are replaced by d-retro inverso (DRI) amylin, that is, peptides where the sequence of amino acids is reversed, and at the same time, the l-amino acids are replaced by their mirror images. Our molecular dynamics simulations show that despite leading to only a marginal difference in the fibril structure and stability, aggregating DRI-amylin peptides have different patterns of contacts and hydrogen bonding. Because of these differences, DRI-amylin, when interacting with regular (l) amylin, alters the elongation process and lowers the stability of hybrid amylin fibrils. Our results not only suggest the potential use of DRI-amylin as an inhibitor of amylin fibril formation but also point to the possibility of using the insertion of DRI proteins in l-assemblies as a way to probe the role of certain kinds of hydrogen bonds in supramolecular assemblies or aggregates.