パキスタンの中程度から重度の散発的な難聴における遺伝的変異のスペクトル

難聴は、環境的または遺伝的原因により、世界中の3億8,000万人に影響を与えます。以前の家族の難聴の歴史のない個人の難聴の原因を決定することは困難であり、パキスタンでは比較的未開拓です。シングルトンのコホートにおける難聴における遺伝的変異のスペクトルを調査しました。中程度から重度の難聴を持つ21人の個人が募集されました。参加者のDNAサンプルについて全エクソームシーケンスを実行しました。これにより、10個の既知の難聴遺伝子と1つの新規候補遺伝子の17のバリアントが特定されました。特定されたすべてのバリアントは、2つを除いてホモ接合体でした。11枚のバリアントは、Otoaの1つの多exonicホモ接合削除を含む斬新でした。ESRRBのミスセンスバリアントは、中程度から重度の難聴から退屈な継承された継承されたものに関係していました。2人の個人は、それぞれMYO7AおよびCHD7のバリアントに対してヘテロ接合であり、難聴の理由として不完全な浸透度を伴うde novoバリアントまたはドミナント継承と一致していました。我々の結果は、難聴の家族性症例と同様に、多数の遺伝子のバリアントが、血族のカップルに生まれた散発的な個人の中程度から重度の難聴の原因であることを示しています。

Hearing loss affects 380 million people worldwide due to environmental or genetic causes. Determining the cause of deafness in individuals without previous family history of hearing loss is challenging and has been relatively unexplored in Pakistan. We investigated the spectrum of genetic variants in hearing loss in a cohort of singleton affected individuals born to consanguineous parents. Twenty-one individuals with moderate to severe hearing loss were recruited. We performed whole-exome sequencing on DNA samples from the participants, which identified seventeen variants in ten known deafness genes and one novel candidate gene. All identified variants were homozygous except for two. Eleven of the variants were novel, including one multi-exonic homozygous deletion in OTOA. A missense variant in ESRRB was implicated for recessively inherited moderate to severe hearing loss. Two individuals were heterozygous for variants in MYO7A and CHD7, respectively, consistent with de novo variants or dominant inheritance with incomplete penetrance as the reason for their hearing loss. Our results indicate that similar to familial cases of deafness, variants in a large number of genes are responsible for moderate to severe hearing loss in sporadic individuals born to consanguineous couples.