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Microbial genomics2020Aug01Vol.6issue(8)

珍しい高毒性のクレブシエラ肺炎st66-k2系統によって引き起こされるコミュニティに敏感な感染症

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文献タイプ:
  • Journal Article
  • Research Support, Non-U.S. Gov't
概要
Abstract

Klebsiella pneumoniae(KP)参照株KP52.145は、実験的なKlebsiella病態生理学で広く使用されています。1935年以来、同じサブリネージのもう1つの株(シーケンスタイプST66、capsular血清型K2)のみが分離されました(AJ210、オーストラリア)。ここでは、フランスのST66-k2 kp株によって引き起こされるコミュニティに取得した侵襲的感染について説明します。急性中耳炎、髄膜炎、菌血症、細菌尿の原因となる4つの高粘度粘性KP分離株は、慢性アルコール依存症および糖尿病の病歴を持つ患者からそれぞれ得られ、HIVに感染しました。分離株は、表現型およびゲノム法によって特徴付けられました。4つの遺伝的に同一のST66-K2分離株は、KP52.145(388 SNP)よりもAJ210(135 SNP)に密接に関連していた単一株(SB5881)に対応する、アンピシリンを含む完全な抗菌薬感受性プロファイルを提示しました。染色体の統合的および共役元素ICEKP10には、コリバクチンおよびYersiniabactin遺伝子クラスターが存在していました。KP52.145の2つのプラスミドは、SB5881で検出されました。毒性因子RMPA、エアロバクチン、サルモケリンの遺伝子を運ぶことに加えて、プラスミドIIは、プラスミドIの共役機械遺伝子クラスターであるSB5881で獲得しました。ヨーロッパ。これは、高衝動および実験室モデルST66-K2サブリネージの長期的な持続性を示しています。単一のプラスミド上の共役装置と主要な毒性遺伝子の組み合わせは、単一のKP株における高毒性と多剤耐性の共起に寄与する可能性があります。

Klebsiella pneumoniae(KP)参照株KP52.145は、実験的なKlebsiella病態生理学で広く使用されています。1935年以来、同じサブリネージのもう1つの株(シーケンスタイプST66、capsular血清型K2)のみが分離されました(AJ210、オーストラリア)。ここでは、フランスのST66-k2 kp株によって引き起こされるコミュニティに取得した侵襲的感染について説明します。急性中耳炎、髄膜炎、菌血症、細菌尿の原因となる4つの高粘度粘性KP分離株は、慢性アルコール依存症および糖尿病の病歴を持つ患者からそれぞれ得られ、HIVに感染しました。分離株は、表現型およびゲノム法によって特徴付けられました。4つの遺伝的に同一のST66-K2分離株は、KP52.145(388 SNP)よりもAJ210(135 SNP)に密接に関連していた単一株(SB5881)に対応する、アンピシリンを含む完全な抗菌薬感受性プロファイルを提示しました。染色体の統合的および共役元素ICEKP10には、コリバクチンおよびYersiniabactin遺伝子クラスターが存在していました。KP52.145の2つのプラスミドは、SB5881で検出されました。毒性因子RMPA、エアロバクチン、サルモケリンの遺伝子を運ぶことに加えて、プラスミドIIは、プラスミドIの共役機械遺伝子クラスターであるSB5881で獲得しました。ヨーロッパ。これは、高衝動および実験室モデルST66-K2サブリネージの長期的な持続性を示しています。単一のプラスミド上の共役装置と主要な毒性遺伝子の組み合わせは、単一のKP株における高毒性と多剤耐性の共起に寄与する可能性があります。

Klebsiella pneumoniae (Kp) reference strain Kp52.145 is widely used in experimental Klebsiella pathophysiology. Since 1935, only one other strain of the same sublineage (sequence type ST66, capsular serotype K2) was isolated (AJ210, Australia). Here, we describe a community-acquired invasive infection caused by a ST66-K2 Kp strain in France. Four hypermucoviscous Kp isolates responsible for acute otitis media, meningitis, bacteraemia and bacteriuria, respectively, were obtained from a patient with a history of chronic alcoholism and diabetes mellitus, and infected with HIV. The isolates were characterized by phenotypic and genomic methods. The four genetically identical ST66-K2 isolates presented a full antimicrobial susceptibility profile, including to ampicillin, corresponding to a single strain (SB5881), which was more closely related to AJ210 (135 SNPs) than to Kp52.145 (388 SNPs). Colibactin and yersiniabactin gene clusters were present on the integrative and conjugative element ICEKp10 in the chromosome. The two plasmids from Kp52.145 were detected in SB5881. In addition to carrying genes for virulence factors RmpA, aerobactin and salmochelin, plasmid II has acquired in SB5881, the conjugation machinery gene cluster from plasmid I. We report the first case of community-acquired infection caused by a hypervirulent ST66-K2 Kp strain in Europe. This demonstrates the long-term persistence of the high-virulence and laboratory model ST66-K2 sublineage. The combination of a conjugative apparatus and major virulence genes on a single plasmid may contribute to the co-occurrence of hypervirulence and multidrug resistance in single Kp strains.

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