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The Journal of antimicrobial chemotherapy2020Oct01Vol.75issue(10)

カナダでのまれなカルバペネマーゼOXA-204の到着により、3年間にわたって複数のアウトブレイクが発生します

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文献タイプ:
  • Journal Article
  • Research Support, Non-U.S. Gov't
概要
Abstract

目的:カナダのケベック州の複数の遠方病院で同時に発生する持続的な多種種OXA-204発生を調査する。 方法:2016年1月から2018年10月の間に複数の病院から分離されたOXA-204カルバペネマーゼ産生エンテロバクテレス(CPE)が研究に含まれました。可能な伝送ルートと推定ソースを解明するために、疫学的調査が実施されました。分離株は、標準化された抗生物質感受性試験と、イルミナの短い読みのデータとミニオンの長い読み取りデータを使用してWGSによって特徴付けられました。 結果:アウトブレイクは、4つの病院サイトから65人の患者と82人の分離株で構成されていました。ほとんどの患者は65歳以上で、複数の併存疾患を持ち、最近抗生物質を受けていました。感染対植民地化率は1:20でした。持続的な環境貯水池は特定されていません。最も頻繁な生物はCitrobacter Freundii(n = 78)で、その後にKlebsiella spp。(n = 3)および大腸菌(n = 1)。WGS分析では、77/78 C. Freundii分離株が0〜26個の単一ヌクレオチドバリアント(SNV)によって異なることが示されました。WGS分析の結果では、Blaoxa-204が3つのプラスミドタイプ(Incx1、Inca/C2およびIncFII/FIB/A/C2)およびプロファージに存在することが示されました。すべてのC. Freundii分離株は、染色体とプラスミドの両方にBlaoxa-204の複数のコピーを抱いていました。プラスミドINCFII/FIB/A/C2が3種すべてで観察されました。 結論:同じ患者内の種間でOXA-204プラスミドの移動が発生した可能性が高く、これらのプラスミドの可塑性と広範な普及の可能性を強調しています。OXA-204カルバペネマーゼはケベックに導入されており、急速に播種しています。このアウトブレイクでは、感染とコロニーの比率は低かったが、このカルバペネマーゼは他の場所での重度の感染に関連している。

目的:カナダのケベック州の複数の遠方病院で同時に発生する持続的な多種種OXA-204発生を調査する。 方法:2016年1月から2018年10月の間に複数の病院から分離されたOXA-204カルバペネマーゼ産生エンテロバクテレス(CPE)が研究に含まれました。可能な伝送ルートと推定ソースを解明するために、疫学的調査が実施されました。分離株は、標準化された抗生物質感受性試験と、イルミナの短い読みのデータとミニオンの長い読み取りデータを使用してWGSによって特徴付けられました。 結果:アウトブレイクは、4つの病院サイトから65人の患者と82人の分離株で構成されていました。ほとんどの患者は65歳以上で、複数の併存疾患を持ち、最近抗生物質を受けていました。感染対植民地化率は1:20でした。持続的な環境貯水池は特定されていません。最も頻繁な生物はCitrobacter Freundii(n = 78)で、その後にKlebsiella spp。(n = 3)および大腸菌(n = 1)。WGS分析では、77/78 C. Freundii分離株が0〜26個の単一ヌクレオチドバリアント(SNV)によって異なることが示されました。WGS分析の結果では、Blaoxa-204が3つのプラスミドタイプ(Incx1、Inca/C2およびIncFII/FIB/A/C2)およびプロファージに存在することが示されました。すべてのC. Freundii分離株は、染色体とプラスミドの両方にBlaoxa-204の複数のコピーを抱いていました。プラスミドINCFII/FIB/A/C2が3種すべてで観察されました。 結論:同じ患者内の種間でOXA-204プラスミドの移動が発生した可能性が高く、これらのプラスミドの可塑性と広範な普及の可能性を強調しています。OXA-204カルバペネマーゼはケベックに導入されており、急速に播種しています。このアウトブレイクでは、感染とコロニーの比率は低かったが、このカルバペネマーゼは他の場所での重度の感染に関連している。

OBJECTIVES: To investigate a persistent multispecies OXA-204 outbreak occurring simultaneously in multiple distant hospitals in the province of Quebec, Canada. METHODS: OXA-204 carbapenemase-producing Enterobacterales (CPE) isolated from multiple hospitals between January 2016 and October 2018 were included in the study. An epidemiological inquiry was conducted in order to elucidate possible transmission routes and a putative source. Isolates were characterized by standardized antibiotic susceptibility testing and by WGS, using Illumina short-read data and MinION long-read data. RESULTS: The outbreak comprised 65 patients and 82 isolates from four hospital sites. Most patients were ≥65 years old, had multiple comorbidities and had received antibiotics recently. The infection to colonization ratio was 1:20. No persistent environmental reservoir was identified. The most frequent organism was Citrobacter freundii (n = 78), followed by Klebsiella spp. (n = 3) and Escherichia coli (n = 1). WGS analysis showed 77/78 C. freundii isolates differing by 0-26 single nucleotide variants (SNVs). Results of WGS analysis showed blaOXA-204 was present on three plasmids types (IncX1, IncA/C2 and IncFII/FIB/A/C2) and on a prophage. All C. freundii isolates harboured multiple copies of blaOXA-204, both on the chromosome and a plasmid. Plasmid IncFII/FIB/A/C2 was observed in all three species. CONCLUSIONS: Transfer of OXA-204 plasmids likely occurred between species within the same patient, highlighting the plasticity of these plasmids and potential for widespread dissemination. OXA-204 carbapenemase has been introduced into Quebec and has rapidly disseminated. Although the infection to colonization ratio was low in this outbreak, this carbapenemase has been associated with severe infection elsewhere.

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