Loading...
Genetica2020Aug01Vol.148issue(3-4)

ブラジルのパンタナール生態系における野生のモンテイロ豚の系統地理学

,
,
,
,
,
,
,
文献タイプ:
  • Journal Article
概要
Abstract

モンテイロは、ブラジルのパンタナール生態系に見られる野生の豚です。この研究の目標は、パンタナール生態系の動物リソースのin vitro保存プログラムの管理と開発に使用できるように、動物集団に関連するKnolewdgeを生成することです。本研究では、19のマイクロサテライトマーカー(n = 189)とミトコンドリアDNA(mtDNA)の対照領域(n = 392)を使用して、地域内の10の異なる場所からサンプリングされた動物を評価しました。マイクロサテライトデータを持つ集団間で低い遺伝的差異が見つかりました。FST範囲は0.009〜0.063でした(p値<0.05)。マントルテストは、遺伝的距離と地理的距離の間の低い相関が観察されたため、以前の結果と裏付けられました(R2 = 0.2309、p = 0.06)。遺伝子構造の同定のためのベイズ分析により、モンテイロブタは3つの主要なクラスター(MOB、POP 1、その他すべてのパンタナル集団)になりました。Monteiro Pigsのほとんどは、mtDNA分析で見られるように、ヨーロッパのハプロタイプを共有しています。このハプロタイプは、他の豚の個体群(市販およびその他の地元産物)と共有されているため、排他的ではありません。パンタナール内のさまざまな地理的位置からのモンテイロ集団は隔離されておらず、大規模なユニークな集団と見なすことができます。動物は食物や水を求めるために自由に歩き回っているため、または生息地の季節的な洪水によるものでさえ、モンテイロの個体群は主要な遺伝的構造の欠如と高い遺伝子流の証拠を示しました。これらの結果は、パンタナール生態系におけるモンテイロ品種の保全と使用のための管理計画と、現場および存在する現場保全プログラムを作成するために使用できます。

モンテイロは、ブラジルのパンタナール生態系に見られる野生の豚です。この研究の目標は、パンタナール生態系の動物リソースのin vitro保存プログラムの管理と開発に使用できるように、動物集団に関連するKnolewdgeを生成することです。本研究では、19のマイクロサテライトマーカー(n = 189)とミトコンドリアDNA(mtDNA)の対照領域(n = 392)を使用して、地域内の10の異なる場所からサンプリングされた動物を評価しました。マイクロサテライトデータを持つ集団間で低い遺伝的差異が見つかりました。FST範囲は0.009〜0.063でした(p値<0.05)。マントルテストは、遺伝的距離と地理的距離の間の低い相関が観察されたため、以前の結果と裏付けられました(R2 = 0.2309、p = 0.06)。遺伝子構造の同定のためのベイズ分析により、モンテイロブタは3つの主要なクラスター(MOB、POP 1、その他すべてのパンタナル集団)になりました。Monteiro Pigsのほとんどは、mtDNA分析で見られるように、ヨーロッパのハプロタイプを共有しています。このハプロタイプは、他の豚の個体群(市販およびその他の地元産物)と共有されているため、排他的ではありません。パンタナール内のさまざまな地理的位置からのモンテイロ集団は隔離されておらず、大規模なユニークな集団と見なすことができます。動物は食物や水を求めるために自由に歩き回っているため、または生息地の季節的な洪水によるものでさえ、モンテイロの個体群は主要な遺伝的構造の欠如と高い遺伝子流の証拠を示しました。これらの結果は、パンタナール生態系におけるモンテイロ品種の保全と使用のための管理計画と、現場および存在する現場保全プログラムを作成するために使用できます。

The Monteiro is a feral pig found in the Brazilian Pantanal ecosystem. The goal of this research is to generate data and knolewdge related to animal populations wich can be used for management and development of an in vitro conservation program for animal resourses at Pantanal ecosystem. The present study evaluated animals sampled from 10 distinct locations within the region, using 19 microsatellite markers (N = 189) and the control region of mitochondrial DNA (mtDNA) (N = 392). Low genetic differences were found between populations with the microsatellite data. The FST range was between 0.009 and 0.063 (p-value < 0.05). The Mantel test corroborated with previous results, as low correlations between genetic and geographic distances were observed (r2 = 0.2309, p = 0.06). Bayesian analysis for genetic structure identification placed the Monteiro pigs into three main clusters (MOB, Pop 1 and all others Pantanal populations). Most of the Monteiro pigs share a single European haplotype as seen by mtDNA analyses. This haplotype is not exclusive, as it is shared with other swine populations (commercial and other locally adapted breeds). Monteiro populations from different geographic locations within Pantanal are not isolated and can be considered as a large unique population. Since animals roam freely to seek food and water, or even due to seasonal flooding of their habitat, the Monteiro populations presented absence of major genetic structure and evidence of high gene flow. These results can be used to create a management plan and in situ and ex situ conservation program for conservation and use of the Monteiro breed in the Pantanal ecosystem.

医師のための臨床サポートサービス

ヒポクラ x マイナビのご紹介

無料会員登録していただくと、さらに便利で効率的な検索が可能になります。

Translated by Google