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Virus research2020Oct02Vol.287issue()

日本のイノシシの間でのE型肝炎ウイルス(HEV)の有病率と遺伝子型/サブタイプ分布:遺伝子型5 HEV株の同定

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文献タイプ:
  • Journal Article
  • Research Support, Non-U.S. Gov't
概要
Abstract

E型肝炎ウイルス(HEV)感染の有病率をさらに調査し、2013年から2019年にかけて日本の17県で捕獲された1880のイノシシが研究されました。全体として、抗HEV IgGは8.9%で検出され、HEV RNAはイノシシの3.9%で検出されました。これは、2003年から2013年の以前の研究に匹敵しました(それぞれ10.3%と3.5%)。本研究で感染したイノシシから得られた74のイノシシのHEV株のうち、50(68%)が遺伝子型3(3aおよび3b)に分類され、23(31%)が遺伝子型4(4i)に分類され、残りの株(wbjgf_19に分類されました。-1)は遺伝子型5に分類されました。WBGF_19-1株は、プロトタイプ遺伝子型5株(JBOAR135-SHIZ09)とゲノム全体で92.7%の同一性を共有しました。JBOAR135-SHIZ09が特定された場所からわずか100 kmに位置する場所にある2番目の遺伝子型5 HEV株の同定は、遺伝子型5 HEVが日本の比較的近距離内で循環することを示唆しています。クレードを形成する遺伝的に類似したHEV株は、11〜13年の観察期間中に各地域に生息する野生のイノシシから特定されましたが、ヌクレオチド配列は徐々に変化し、412ヌクレオチドORF2配列内で最大3.4〜3.6%を占めました。HEV感染症のクラスターを持つ8つのイノシシが観察されました。これは、おそらく母親と一緒に同じ母親または子孫に生まれた2つ、3つ、または4つの感染した子孫で構成されています。これらの結果は、イノシシが日本のヒトにおけるHEV感染の重要な貯水池であり続けていることを示唆しています。

E型肝炎ウイルス(HEV)感染の有病率をさらに調査し、2013年から2019年にかけて日本の17県で捕獲された1880のイノシシが研究されました。全体として、抗HEV IgGは8.9%で検出され、HEV RNAはイノシシの3.9%で検出されました。これは、2003年から2013年の以前の研究に匹敵しました(それぞれ10.3%と3.5%)。本研究で感染したイノシシから得られた74のイノシシのHEV株のうち、50(68%)が遺伝子型3(3aおよび3b)に分類され、23(31%)が遺伝子型4(4i)に分類され、残りの株(wbjgf_19に分類されました。-1)は遺伝子型5に分類されました。WBGF_19-1株は、プロトタイプ遺伝子型5株(JBOAR135-SHIZ09)とゲノム全体で92.7%の同一性を共有しました。JBOAR135-SHIZ09が特定された場所からわずか100 kmに位置する場所にある2番目の遺伝子型5 HEV株の同定は、遺伝子型5 HEVが日本の比較的近距離内で循環することを示唆しています。クレードを形成する遺伝的に類似したHEV株は、11〜13年の観察期間中に各地域に生息する野生のイノシシから特定されましたが、ヌクレオチド配列は徐々に変化し、412ヌクレオチドORF2配列内で最大3.4〜3.6%を占めました。HEV感染症のクラスターを持つ8つのイノシシが観察されました。これは、おそらく母親と一緒に同じ母親または子孫に生まれた2つ、3つ、または4つの感染した子孫で構成されています。これらの結果は、イノシシが日本のヒトにおけるHEV感染の重要な貯水池であり続けていることを示唆しています。

To further investigate the prevalence of hepatitis E virus (HEV) infection and characterize HEV genomes among Japanese wild boars (Sus scrofa leucomystax), 1880 boars captured in 17 prefectures in Japan from 2013 to 2019 were studied. Overall, anti-HEV IgG was detected in 8.9 % and HEV RNA was detected in 3.9 % of boars, which was comparable with our previous studies during 2003-2013 (10.3 % and 3.5 %, respectively). Among 74 boar HEV strains obtained from infected boars in the present study, 50 (68 %) were classified into genotype 3 (3a and 3b), 23 (31 %) were classified into genotype 4 (4i), and the remaining strain (wbJGF_19-1) was classified into genotype 5. The wbGF_19-1 strain shared 92.7 % identity over the entire genome with the prototype genotype 5 strain (JBOAR135-Shiz09). The identification of the second genotype 5 HEV strain in a place that is located only 100 km from the site at which JBOAR135-Shiz09 was identified, suggests that genotype 5 HEV circulates within a relatively close range in Japan. Genetically similar HEV strains forming a clade were identified from wild boars living in each area during the observation period of 11-13 years, although the nucleotide sequence changed gradually, accounting for up to 3.4-3.6 % within the 412-nucleotide ORF2 sequence. Eight groups of boars with a cluster of HEV infections were observed, consisting of two, three or four infected offspring, presumably born to the same mother or offspring with their mother. These results suggest that wild boars continue to be important reservoirs for HEV infection in humans in Japan.

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