黒人アフリカ人におけるGPB欠損血液型MNS表現型S-U-の原因となる2つの一般的な〜100 kbのGypb欠失

U抗原（MNS5）は、グリコフォリンA（GPA）およびB（GPB）で運ばれたMNS血液層システム（ISBT002）に属する49の抗原の1つです。Uは、ほぼすべてのヨーロッパ人とアジア人の赤血球に存在しますが、黒人アフリカ人の約1.0％に存在していません。U Negativityは、GPB上のS（MNS3）とS（MNS4）の否定性と一致し、したがってS-S-U-と呼ばれ、GYPBのホモ接合削除から生じると考えられています。これらの削除の分子背景についてはほとんど知られていない。1000ゲノムプロジェクトデータのバイオインフォマティック分析により、GYPBの明らかな削除があるいくつかの候補領域が明らかになりました。削除が存在するDNAからの正の増幅のみをもたらすだけで、非常に特異的なギャップPCRSは、3つの異なるブレークポイントの正確な遺伝的局在化が可能になりました。110.24-および103.26-kbの削除は、黒人アメリカ人やアフリカ人で最も頻繁に見られることが証明されていました。157のCeph DNAのうち、8つのアフリカの民族のうち6つの削除が存在していました。アフリカの民族内の削除の対立遺伝子頻度は大きく異なり、コンゴのMbuti pygmyの人々の間で累積23.3％に達しました。GPB発現が大幅に低下することが知られているU+var対立遺伝子についても同様の観察が行われました。110および103 kbの欠失GYPBハプロタイプは、MNS血液型の表現型S-u-の原因となる最も一般的な遺伝的要因を表すことがわかった。それぞれのGYPBの削除は、ホモおよびhemigus透過の分子検出によってアクセス可能になりました。

The U antigen (MNS5) is one of 49 antigens belonging to the MNS blood group system (ISBT002) carried on glycophorins A (GPA) and B (GPB). U is present on the red blood cells in almost all Europeans and Asians but absent in approximately 1.0% of Black Africans. U negativity coincides with negativity for S (MNS3) and s (MNS4) on GPB, thus be called S-s-U-, and is thought to arise from homozygous deletion of GYPB. Little is known about the molecular background of these deletions. Bioinformatic analysis of the 1000 Genomes Project data revealed several candidate regions with apparent deletions in GYPB. Highly specific Gap-PCRs, only resulting in positive amplification from DNAs with deletions present, allowed for the exact genetic localization of 3 different breakpoints; 110.24- and 103.26-kb deletions were proven to be the most frequent in Black Americans and Africans. Among 157 CEPH DNAs, deletions in 6 out of 8 African ethnicities were present. Allele frequencies of the deletions within African ethnicities varied greatly and reached a cumulative 23.3% among the Mbuti Pygmy people from the Congo. Similar observations were made for U+var alleles, known to cause strongly reduced GPB expression. The 110- and 103-kb deletional GYPB haplotypes were found to represent the most prevalent hereditary factors causative of the MNS blood group phenotype S-s-U-. Respective GYPB deletions are now accessible by molecular detection of homo- and hemizygous transmission.