Mitocarta30：サブオルガネルの局在と経路注釈を備えた更新されたミトコンドリアプロテオーム

哺乳類のミトコンドリアプロテオームは二重ゲノム制御下にあり、99％のタンパク質が核ゲノムによってコードされ、13はミトコンドリアDNA（mtDNA）に由来します。以前、哺乳類のミトコンドリアプロテオームをコードする1000を超える遺伝子のカタログであるMitocartaを開発しました。このカタログは、複数のシーケンス機能と実験データセットのベイジアン統合、特に14のマウス組織から分離されたミトコンドリアのタンパク質質量分析を使用してコンパイルされました。ここでは、mitocarta3.0を紹介します。Mitocarta2.0インベントリから始めて、100の遺伝子を除去し、78の追加遺伝子を導入するために手動レビューを実行し、1136のヒト遺伝子の更新されたインベントリに到達しました。現在、ミトコンドリア局在（マトリックス、内膜、膜間空間、外膜）の手動でキュレーションされた注釈と、ミトコンドリアに関連する7つの広範な機能カテゴリにまたがる149階層の「ミトパスウェイ」への割り当てが含まれています。Mitocarta3.0は、ミトコンドリアの局在化とMitopathwayアノテーションを含む、http：//www.broadinstitute.org/mitocartaで自由に利用でき、ミトコンドリアの生物学と医学の継続的なコミュニティリソースとして機能するはずです。

The mammalian mitochondrial proteome is under dual genomic control, with 99% of proteins encoded by the nuclear genome and 13 originating from the mitochondrial DNA (mtDNA). We previously developed MitoCarta, a catalogue of over 1000 genes encoding the mammalian mitochondrial proteome. This catalogue was compiled using a Bayesian integration of multiple sequence features and experimental datasets, notably protein mass spectrometry of mitochondria isolated from fourteen murine tissues. Here, we introduce MitoCarta3.0. Beginning with the MitoCarta2.0 inventory, we performed manual review to remove 100 genes and introduce 78 additional genes, arriving at an updated inventory of 1136 human genes. We now include manually curated annotations of sub-mitochondrial localization (matrix, inner membrane, intermembrane space, outer membrane) as well as assignment to 149 hierarchical 'MitoPathways' spanning seven broad functional categories relevant to mitochondria. MitoCarta3.0, including sub-mitochondrial localization and MitoPathway annotations, is freely available at http://www.broadinstitute.org/mitocarta and should serve as a continued community resource for mitochondrial biology and medicine.