茶植物（Camellia sinensis）の特徴的な二次代謝産物のための新規遺伝子マイニングにおける予測されるタンパク質官能的ネットワークは

関係する種のタンパク質官能ネットワークのモデリングは、特定の生物学的経路で新規遺伝子を特定するための効率的なアプローチです。茶植物（Camellia sinensis）は、茶の質と健康上の利点をもたらす多数の特徴的な二次代謝産物（ポリフェノール、アルカロイド、アルカロイドなど）に豊富な重要な商業作物です。TEA特性成分の原因となる新規遺伝子のデコードは、応用遺伝的改善と代謝工学の重要な基礎です。ここでは、茶植物の高品質タンパク質機能ネットワーク（TEAPON）を、厳密な生物学的ネットワーク基準制御と組み合わせた、異種間タンパク質官能的な関連性を使用して予測されました。Teaponには、6,634の茶タンパク質（または遺伝子）の間で31,273の非冗長機能相互作用が含まれており、スケールフリーや小世界などの一般的なネットワークトポロジカル特性がありました。Teaponで、主要な3つの茶特性成分（Theanine、Caffeine、Catechin）に関連する遺伝子のモジュラー組織を明らかにしました。重要なことに、茶特性成分の遺伝子同定に関するいくつかのケーススタディが提示されました。Teaponの使用を支援するために、データデポジットと新しい遺伝子スクリーニングのための簡潔なWebインターフェイスが開発されました（http://teapon.wchoda.com）。Teaponは、茶植物の特徴的な二次代謝産物に関連する機能的ゲノミクス研究の有用なプラットフォームとして機能すると考えています。

Modeling a protein functional network in concerned species is an efficient approach for identifying novel genes in certain biological pathways. Tea plant (Camellia sinensis) is an important commercial crop abundant in numerous characteristic secondary metabolites (e.g., polyphenols, alkaloids, alkaloids) that confer tea quality and health benefits. Decoding novel genes responsible for tea characteristic components is an important basis for applied genetic improvement and metabolic engineering. Herein, a high-quality protein functional network for tea plant (TeaPoN) was predicted using cross-species protein functional associations transferring and integration combined with a stringent biological network criterion control. TeaPoN contained 31,273 nonredundant functional interactions among 6,634 tea proteins (or genes), with general network topological properties such as scale-free and small-world. We revealed the modular organization of genes related to the major three tea characteristic components (theanine, caffeine, catechin) in TeaPoN, which served as strong evidence for the utility of TeaPoN in novel gene mining. Importantly, several case studies regarding gene identification for tea characteristic components were presented. To aid in the use of TeaPoN, a concise web interface for data deposit and novel gene screening was developed (http://teapon.wchoda.com). We believe that TeaPoN will serve as a useful platform for functional genomics studies associated with characteristic secondary metabolites in tea plant.