TGCTバイオマーカーを探して：包括的なシリコおよび組織病理学的分析

精巣胚細胞腫瘍（TGCT）は、若い男性集団にもっと影響を与えています。in situ（GCNIS）の生殖細胞新生物は、TGCTの起源、すなわち半腫（SE）および胚癌、催奇形腫、ヨルク嚢腫瘍、胆汁癌を含む非ゼミノーマ（NS）の不均一な群です。特にNSの治療と予後に対する反応は、新しいバイオマーカーの発見に必要な正確な診断に依存しています。DNA、RNA、および6つの前向きのタンパク質レベル（Hoxa9、MGMT、CFC1、PRSS21、RASSF1A、およびMAGEC2）と6つの既知のTGCTバイオマーカー（OCT4、SOX17、SOX17、SOX2、SALL4、NANOG、NANOG、NANOG、NANOG、NANOG、NANOG、NANOG、包括的なインシリコ分析を実施することを目指しました。キット）およびTGCTのあらゆる形態の組織病理学的分析との一致を評価します。Cancer Hallks Analyticsツール、相互作用する遺伝子/タンパク質データベースの検索の検索ツール、およびがんデータを分析するためのインタラクティブなWebリソースであるUalcanが使用されました。108のTGCTおよび48の腫瘍を含まない精巣サンプルで、免疫反応性スコア（IRS）が計算されました。SEはDNAの変化により高い頻度を示したが、DNAメチル化はNSのすべての前向きバイオマーカーで有意に高かった。GCNISでは、サンプルの52％と62％でそれぞれRassf1およびPRSS21の臨床陽性を評価しました。健康なセミニン尿細管（HT）とGCNIの約80％に存在しますが、HOXA9はTGCTの64％で診断的に陽性でしたが、NSの82％でSEの29％で陽性でした。DNA、mRNA、および推定およびすでに既知のバイオマーカーのタンパク質レベルでの結果は、さまざまな形態のTGCTのより良い診断に重要であることが証明される可能性のある提案パネルに含まれていました。

Testicular germ cell tumors (TGCTs) are ever more affecting the young male population. Germ cell neoplasia in situ (GCNIS) is the origin of TGCTs, namely, seminomas (SE) and a heterogeneous group of nonseminomas (NS) comprising embryonal carcinoma, teratoma, yolk sac tumor, and choriocarcinoma. Response to the treatment and prognosis, especially of NS, depend on precise diagnosis with a necessity for discovery of new biomarkers. We aimed to perform comprehensive in silico analysis at the DNA, RNA, and protein levels of six prospective (HOXA9, MGMT, CFC1, PRSS21, RASSF1A, and MAGEC2) and six known TGCT biomarkers (OCT4, SOX17, SOX2, SALL4, NANOG, and KIT) and assess its congruence with histopathological analysis in all forms of TGCTs. Cancer Hallmarks Analytics Tool, the Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins database, and UALCAN, an interactive web resource for analyzing cancer OMICS data, were used. In 108 TGCT and 48 tumor-free testicular samples, the immunoreactivity score (IRS) was calculated. SE showed higher frequency in DNA alteration, while DNA methylation was significantly higher for all prospective biomarkers in NS. In GCNIS, we assessed the clinical positivity of RASSF1 and PRSS21 in 52% and 62% of samples, respectively, in contrast to low or nil positivity in healthy seminiferous tubules, TGTCs as a group, SE, NS, or all NS components. Although present in approximately 80% of healthy seminiferous tubules (HT) and GCNIS, HOXA9 was diagnostically positive in 64% of TGCTs, while it was positive in 82% of NS versus 29% of SE. Results at the DNA, mRNA, and protein levels on putative and already known biomarkers were included in the suggested panels that may prove to be important for better diagnostics of various forms of TGCTs.