PACBIOの続編IIを使用したフルレングストランスクリプトームアセンブリとApocynum venetumの注釈のデータセット

アポシナ科に属するApocynum venetumは、地中海地域と中国北西部の塩塩基ゾーン、砂漠の草原、および沖積フラット全体に広く分布しています。Apocynum Venetumは、抗炎症、抗酸化、抗肥大症、抗がん、および殺菌効果のために、伝統的な漢方薬で長い間使用されてきました。ただし、Apocynum Venetumに関する遺伝情報がないことは、ストレス耐性または薬用機能を理解するための障害です。この作業は、Pacific Bioscience（PACBIO）シングル分子リアルタイム（SMRT）シーケンステクノロジーを使用して、Apocynum Venetumのフルレングストランスクリプトームを生成することを目的としていました。合計18,524個のユニゲンが得られ、18,136個のユニゲンに正常に注釈が付けられました。生データはSRAデータベースにアップロードされ、BioProject IDはPRJNA650225です。上記のデータは、Apocynum Venetumのストレス耐性または薬用機能における分子メカニズムのさらなる調査と理解の基礎を提供します。

Apocynum venetum, which belongs to Apocynaceae, is widely distributed throughout salt-barren zones, desert steppes, and alluvial flats of the Mediterranean area and Northwestern China. Apocynum venetum has long been used in traditional Chinese medicine because of its anti-inflammation, anti-oxidative, anti-hypertensive, anti-cancer, and bactericidal effects. However, the absence of genetic information on Apocynum venetum is an obstacle to understanding its stress resistance or medicinal function. This work was aimed at generating a full-length transcriptome of Apocynum venetum using Pacific Bioscience (PacBio) Single Molecule Real-Time (SMRT) sequencing technology. A total of 18,524 unigenes were obtained, and 18,136 unigenes were successfully annotated. The raw data were uploaded to SRA database, and the BioProject ID is PRJNA650225. The above data will provide the basis for further exploration and understanding of the molecular mechanism in stress resistance or medicinal function of Apocynum venetum.