シルクフロスツリーの葉緑体ゲノム（Ceiba speciosa）

シルクフロスツリーとも呼ばれるCeiba Speciosa（Malvaceae）は、南アメリカの熱帯および亜熱帯の森林に自生した美しく落葉樹です。その系統発生の位置は不明のままです。この研究では、C。peciosaの完全な葉緑体ゲノム配列が報告されました。その葉緑体ゲノムサイズは160,360 bpで、19,947 bpの小さな単一コピー（SSC）領域と89,393 bpの大きな単一コピー領域（LSC）、およびそれぞれ25,510 bpの2つの反転リピート（IRS）が含まれています。合計で、86個のタンパク質コーディング遺伝子、37個のTRNA遺伝子、8個のRRNA遺伝子を含む葉緑体ゲノムに129個の遺伝子に注釈が付けられました。系統解析により、C。peciosaがBombax Ceibaの姉妹であることが示されました。

Ceiba speciosa (Malvaceae), also called silk floss tree, is a beautiful and deciduous tree native to tropical and subtropical forests of South America. Its phylogenetic position remains unclear. In this study, the complete chloroplast genome sequence of C. speciosa was reported. Its chloroplast genome size was 160,360 bp, which contains a small single copy (SSC) region of 19,947 bp and a large single copy region (LSC) of 89,393 bp, and two inverted repeats (IRs) of 25,510 bp each. In total, 129 genes were annotated for the chloroplast genome, including 86 protein-coding genes, 37 tRNA genes and 8 rRNA genes. Phylogenetic analysis showed that C. speciosa was sister to Bombax ceiba.